Department and laboratory
Department: Department of Soil and Plant System
Publications
-
-
Sokołowski Artur,
-
Siegieda Dominika,
-
Panek Jacek,
-
Frąc Magdalena,
-
Kobyłecki Rafał,
-
Zarzycki Robert,
-
Klepka Tomasz,
-
Oleszczuk Patryk,
-
Gao Yanzheng,
-
Bożena Czech,
2026,
Long-term biochar amendment promotes microbial resilience and detoxification in phthalate-contaminated soil,
Applied Soil Ecology,
218: 106708; DOI: 10.1016/j.apsoil.2025.106708
-
-
Panek Jacek,
-
Gryta Agata,
-
Maj Wiktoria,
-
Mącik Mateusz,
-
Oszust Karolina,
-
Pertile Giorgia,
-
Pylak Michał,
-
Siegieda Dominika,
-
Hallama Moritz,
-
Hatano Ryusuke,
-
Kandeler Ellen,
-
Pathan Shamina Imran,
-
Pietramellara Giacomo,
-
Eligio Malusa,
-
Weber Jerzy,
-
Turnau Katarzyna,
-
Różalska Sylwia,
-
Frąc Magdalena,
2026,
Plant–soil–microbiome interactions: mechanisms, advances, and challenges in sustainable agriculture and healthy agroecosystems,
Frontiers in Microbiology,
20;17:1762743, DOI:10.3389/fmicb.2026.1762743
-
2026,
Exploring the biology and agricultural potential of entomopathogenic fungi from Akanthomyces genera,
5. Lenga A., Siegieda D., Różalska S., Frąc M. (2026) Exploring the biology and agricultural potential of entomopathogenic fungi from Akanthomyces genera.,
25th International Workshop for Young Scientists “BioPhys Spring 2026”, Prague, Czech Republic, 28-29 maja 2026 r.,
110-111
-
-
Sisodia Priyal,
-
Gryta Agata,
-
Siegieda Dominika,
-
Panek Jacek,
-
Oszust Karolina,
-
Pylak Michał,
-
Mącik Mateusz,
-
Feledyn-Szewczyk Beata,
-
Pathan Shamina Imran,
-
Pietramellara Giacomo,
-
Frąc Magdalena,
2026,
Intercropping enhances soil microbial biodiversity and reorganizes seasonal functioning in wheat-clover systems,
25th International Workshop for Young Scientists “BioPhys Spring 2026”, Prague, Czech Republic, 28-29 maja 2026 r.,
124-125
-
2025,
Impact of microbial-based biopreparations on soil quality, plant health, and fruit chemistry in raspberry cultivation,
Food Chemistry,
462, 140943, DOI: 10.1016/j.foodchem.2024.140943
-
2025,
Distribution and colonization of Bacillus megaterium B107/23 in Microgreens – First insights,
5. Warsztaty dla Młodych Badaczy, Lublin, 18-19 listopada 2025 r.,
9-10
-
-
Sisodia Priyal,
-
Gryta Agata,
-
Siegieda Dominika,
-
Panek Jacek,
-
Oszust Karolina,
-
Pylak Michał,
-
Mącik Mateusz,
-
Feledyn-Szewczyk Beata,
-
Pathan Shamina Imran,
-
Pietramellara Giacomo,
-
Frąc Magdalena,
2025,
The seasonal resilience of soil microbial communities and functional profiles is strengthened by intercropping,
5. Warsztaty dla Młodych Badaczy, Lublin, 18-19.11.2025 r.,
34-35
-
2025,
Transfer mikrobiomu w obrębie holobiontu roślinnego jako strategia rozwoju zrównoważonej produkcji roślinnej,
IX. Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „METAGENOMY RÓŻNYCH ŚRODOWISK”, Lublin, 23–24.06.2025 r.,
65-65
-
2025,
Potencjał funkcjonalny mikrobiomu gleby w uprawie współrzędnej roślin bobowatych i zbóż,
IX. Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „METAGENOMY RÓŻNYCH ŚRODOWISK”, Lublin, 23–24.06.2025 r.,
74-74
-
2025,
Rezystom bakterii Priestia megaterium,
IX. Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „METAGENOMY RÓŻNYCH ŚRODOWISK”, Lublin, 23–24.06.2025 r.,
98-98
-
-
Sisodia Priyal,
-
Gryta Agata,
-
Siegieda Dominika,
-
Oszust Karolina,
-
Mącik Mateusz,
-
Pylak Michał,
-
Feledyn-Szewczyk Beata,
-
Pathan Shamina Imran,
-
Pietramellara Giacomo,
-
Frąc Magdalena,
2025,
Wpływ uprawy współrzędnej na strukturę mikrobiologiczną gleby i potencjał funkcjonalny grzybów glebowych w systemie pszenica-koniczyna,
IX. Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „METAGENOMY RÓŻNYCH ŚRODOWISK”, Lublin, 23–24.06.2025 r.,
110-110
-
2025,
W kierunku zrównoważonego zarządzania glebą: jak współrzędne systemy uprawy kształtują funkcjonalność mikrobiomu?,
IX. Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „METAGENOMY RÓŻNYCH ŚRODOWISK”, Lublin, 23–24.06.2025 r.,
152-152
-
2025,
Wpływ uprawy współrzędnej pszenicy jarej z mieszanką trawy i koniczyny czerwonej na skład taksonomiczny mikroorganizmów glebowych w uprawie ekologicznej,
IX. Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „METAGENOMY RÓŻNYCH ŚRODOWISK”, Lublin, 23–24.06.2025 r.,
157-157
-
2025,
Zasada Anny Kareniny w mikrobiomie: jak Pilidium lythri destabilizuje społeczności bakteryjne w glebie,
IX. Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „METAGENOMY RÓŻNYCH ŚRODOWISK”, Lublin, 23–24.06.2025 r.,
160-160
-
2025,
Pilidium lythri: from tropical origins to temperate invasion – genomic sequencing and de novo assembly,
European Conference on Fungal Genetics (ECFG17), Dublin, Ireland, 2-5.03.2025 r. ,
P2.158, 265-266
-
-
Frąc Magdalena,
-
Siegieda Dominika,
-
Pinzari Flavia,
-
Panek Jacek,
-
Gryta Agata,
-
Oszust Karolina,
-
Pylak Michał,
-
Mącik Mateusz,
-
Loredana Canfora,
-
Zięć Gabriela,
-
Gabriele Berg,
-
Eligio Malusa,
2025,
Priming and toxic effects of biostimulants on microbial functional diversity of seeds,
17th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology „Bacteria drive our planet`s health" BAGECO 2025, Graz, Austria, 1-4.07.2025 r.,
P042
-
2025,
Preliminary results on bacterial and fungal microbiome transfer to wheat roots and rhizosphere in legume-cereal intercropping,
5th Conference on Ecology of Soil Microorganisms 2025, Helsinki, Finland, 15-19.06.2025 r.,
TUE P9
-
-
Sisodia Priyal,
-
Gryta Agata,
-
Panek Jacek,
-
Siegieda Dominika,
-
Mącik Mateusz,
-
Pylak Michał,
-
Oszust Karolina,
-
Feledyn-Szewczyk Beata,
-
Pathan Shamina Imran,
-
Pietramellara Giacomo,
-
Frąc Magdalena,
2025,
Intercropping boosts seasonal stability in soil micro-biomes and functional pathways,
VIII Konferencja Doktorantów pt. „Cztery Żywioły – współczesne problemy w naukach o życiu”, Warszawa-Lublin, 12.12.2025 r.,
5, 7-7
-
2025,
Entomopathogenic Fungi: Opportunities for Sustainable Crop Protection in the Era of Pesticide Reduction,
VIII Konferencja Doktorantów pt. „Cztery Żywioły – współczesne problemy w naukach o życiu”, Warszawa-Lublin, 12.12.2025 r.,
6, 8-8
-
2025,
First Insights into the Colonisation and Distribution of the B. megaterium B107/23 Strain in Microgreens tissues,
VIII Konferencja Doktorantów pt. „Cztery Żywioły – współczesne problemy w naukach o życiu”, Warszawa-Lublin, 12.12.2025 r.,
10, 12-13
-
-
Sisodia Priyal,
-
Gryta Agata,
-
Panek Jacek,
-
Siegieda Dominika,
-
Mącik Mateusz,
-
Pylak Michał,
-
Oszust Karolina,
-
Pathan Shamina Imran,
-
Pietramellara Giacomo,
-
Frąc Magdalena,
2024,
Shaping the bacterial and fungal microbiome in legume-cereal intercropping,
23rd International Workshop for Young Scientists „BioPhys Spring 2024”; Lublin, Poland, 23-24 maja 2024 r.,
str. 131-132
-
2024,
Ecological processes of bacterial microbiome assembly in healthy and dysbiotic strawberry farms,
BMC Plant Biology ,
24: 692; DOI: 10.1186/s12870-024-05415-8
-
2024,
Analiza sieci powiązań zbiorowisk bakterii w uprawie współrzędnej pszenicy i koniczyny,
VIII Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy Różnych Środowisk”, Lublin, 17-18 czerwca 2024 r.,
str. 61
-
2024,
Mikrobiom glebowy pod lupą: funkcjonalna analiza zbiorowisk bakterii w uprawach współrzędnych zbóż i roślin bobowatych,
VIII Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy Różnych Środowisk”, Lublin, 17-18 czerwca 2024 r.,
str. 100
-
2024,
Mikrobiom endosymbiotyczny grzybów Serendipita indica,
VIII Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy Różnych Środowisk”, Lublin, 17-18 czerwca 2024 r.,
str. 105
-
2024,
Wpływ uprawy współrzędnej pszenicy wraz z mieszanką trawy i koniczyny na bioróżnorodność zbiorowisk bakterii w podpowierzchniowych warstwach gleby w rolnictwie ekologicznym,
VIII Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy Różnych Środowisk”, Lublin, 17-18 czerwca 2024 r.,
str. 111
-
2024,
Głębokość czy rodzaj uprawy? Co ma większy wpływ na różnorodność mikrobiomów bakteryjnych i grzybowych w glebie?,
VIII Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy Różnych Środowisk”, Lublin, 17-18 czerwca 2024 r.,
str. 118
-
2024,
Pierwsze kroki do opisania niescharakteryzowanego patogena roślin – Pilidium lythri,
IV Ogólnopolska Konferencja Polskiego Towarzystwa Mykologicznego, Lublin, 20-22 września 2024 r.,
str. 42
-
2024,
Mykobiom jako składnik holobiontu roślinnego i mikrobiomu glebowego dla zrównoważonej produkcji i zdrowia agroekosystemów,
IV Ogólnopolska Konferencja Polskiego Towarzystwa Mykologicznego, Lublin, 20-22 września 2024 r.,
str. 100
-
2024,
Mykobiom w służbie zdrowia gleby: jak sposób uprawy kształtuje profil funkcjonalny zbiorowisk grzybów?,
IV Ogólnopolska Konferencja Polskiego Towarzystwa Mykologicznego, Lublin, 20-22 września 2024 r.,
str. 115
-
2024,
Wpływ uprawy współrzędnej pszenicy na skład taksonomiczny oraz wskaźniki bioróżnorodności zbiorowisk grzybów występujących w warstwach podpowierzchniowych gleby w uprawie ekologicznej,
IV Ogólnopolska Konferencja Polskiego Towarzystwa Mykologicznego, Lublin, 20-22 września 2024 r.,
str. 121
-
2024,
Analiza różnorodności genetycznej zbiorowisk mikroorganizmów w warstwach podpowierzchniowych gleby w różnych systemach uprawy zbóż i roślin bobowatych,
56 Ogólnopolska Konferencja Mikrobiologiczna „Mikrolobiczne wyzwania – rozwiązania dla środowiska i zdrowia”, Bydgoszcz, Fojutowo, 11-13 września 2024 r.,
-
2024,
Analiza funkcjonalna genomu Serendipita indica,
56 Ogólnopolska Konferencja Mikrobiologiczna „Mikrolobiczne wyzwania – rozwiązania dla środowiska i zdrowia”, Bydgoszcz, Fojutowo, 11-13 września 2024 r.,
-
2024,
Holobiont roślinny i mikrobiom glebowy szansą dla zrównoważonej produkcji i zdrowia agroekosystemów,
VI Konferencja Naukowa „Bioróżnorodność środowiska glebowego”, Puławy, 5-6 września 2024 r.,
31-31
-
2024,
Analiza rezystomu endofitycznego grzyba Serendipita indica,
VI Konferencja Naukowa „Bioróżnorodność środowiska glebowego”, Puławy, 5-6 września 2024 r.,
45-45
-
2024,
Wpływ ekologicznej uprawy współrzędnej pszenicy na wskaźniki bioróżnorodności zbiorowisk mikroorganizmów glebowych w warstwach podpowierzchniowych gleby,
VI Konferencja Naukowa „Bioróżnorodność środowiska glebowego”, Puławy, 5-6 września 2024 r.,
47-47
-
2023,
Plant and soil health in organic strawberry farms – Greater importance of fungal trophic modes and networks than α-diversity of the mycobiome,
Applied Soil Ecology,
vol. 188, 104925; DOI: 10.1016/j.apsoil.2023.104925
-
2023,
How to approach biodiversity analysis in metagenomic studies,
14th International Conference on Agrophysics (ICA 2023); Lublin, Polska, 11-13 września 2023 r.,
63-63
-
2023,
An alarming abundance of Pilidium sp., an emerging phytopathogen, in organic strawberry farms in Poland,
14th International Conference on Agrophysics (ICA 2023); Lublin, Polska, 11-13 września 2023 r.,
140-140
-
-
Mącik Mateusz,
-
Panek Jacek,
-
Gryta Agata,
-
Oszust Karolina,
-
Pertile Giorgia,
-
Siegieda Dominika,
-
Pylak Michał,
-
Pathan Shamina Imran,
-
Pietramellara Giacomo,
-
Frąc Magdalena,
2023,
Legume-cereal intercropping as a tool for improving soil quality and plant health,
14th International Conference on Agrophysics (ICA 2023); Lublin, Polska, 11-13 września 2023 r.,
142-142
-
2023,
Sztuczna inteligencja w badaniach zdrowotności upraw truskawek,
VII Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „METAGENOMY RÓŻNYCH ŚRODOWISK” 2023, Lublin, 20-21 czerwca 2023 r.,
120-120
-
2023,
Zbiorowiska bakterii zdrowych i zainfekowanych patogenami plantacji truskawek – zróżnicowanie obfitości i bogactwa mikrobioty,
VII Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „METAGENOMY RÓŻNYCH ŚRODOWISK” 2023, Lublin, 20-21 czerwca 2023 r.,
158-158
-
-
Frąc Magdalena,
-
Panek Jacek,
-
Gryta Agata,
-
Oszust Karolina,
-
Pertile Giorgia,
-
Siegieda Dominika,
-
Mącik Mateusz,
-
Pylak Michał,
-
Pathan Shamina Imran,
-
Pietramellara Giacomo,
2023,
Uprawa współrzędna zbóż i roślin bobowatych dla rozwoju zrównoważonego rolnictwa – bioróżnorodność i aspekt metagenomiczny,
VII Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „METAGENOMY RÓŻNYCH ŚRODOWISK” 2023, Lublin, 20-21 czerwca 2023 r.,
162-162
-
-
Mącik Mateusz,
-
Panek Jacek,
-
Gryta Agata,
-
Oszust Karolina,
-
Pertile Giorgia,
-
Siegieda Dominika,
-
Pylak Michał,
-
Pathan Shamina Imran,
-
Pietramellara Giacomo,
-
Frąc Magdalena,
2023,
Zastosowanie strategii uprawy współrzędnej roślin bobowatych i zbóż do optymalizacji bilansu azotu i jakości mikrobiologicznej gleby,
55 jubileuszowa konferencja mikrobiologiczna „Mikrobiologia w badaniach środowiskowych – rys historyczny i perspektywy na przyszłość”, Puławy, 14-15 września 2023 r.,
82-82
-
2023,
Tracking depletion and enrichment of mycobiomes in healthy and unhealthy strawberry plant and soil niches,
4th conference „MycoRiseUP! Youth in Mycology”, Lublin, 20-21 May 2023 r.,
57-57
-
2023,
Soil microbiomes biodiversity in agroecosystems,
3rd Global Soil Biodiversity Conference, Dublin, Ireland, 13-15.03.2023 r. ,
467-467
-
2022,
METATAXONOMY IN ORGANIC STRAWBERRY CULTIVATION – WHAT’S THE BIG DEAL?,
21th International Workshop for Young Scientists „BioPhys Spring 2022”; 30-31.05.2022,
str. 97-98
-
2022,
Strategie poprawy efektywności wykorzystania zasobów glebowych poprzez interakcje między roślinami a mikrobiomami – odrębne grupy mikrobiomu odmian ziemniaka i ich troficzne gildie grzybowe,
Ogólnopolska Konferencja Naukowa z okazji 10-lecia Polskiego Towarzystwa Mykologicznego; 24-28.09.2022 ,
str. 66
-
2022,
Czy grzyby tworzą dobre sieci? Sieci grzybowych powiązań w mykobiomie zdrowych i porażonych plantacji truskawki,
Ogólnopolska Konferencja Naukowa z okazji 10-lecia Polskiego Towarzystwa Mykologicznego; 24-28.09.2022,
str. 111
-
2022,
Correlations between fungal trophic modes in healthy and unhealthy strawberry samples,
MycoRise Up! Youth in Mycology; Warszawa 27-29.05.2022 ,
str. 21
-
2022,
Obfitość grzybów fitopatogenicznych oraz pozostałych gildii w glebie, ryzosferze, korzeniach i liściach ekologicznej truskawki,
Konferencja Polskiego Towarzystwa Fitopatologicznego „Nowoczesne spojrzenie na fitopatologię”, Poznań, 7-8 Września 2022 r.,
str. 43
-
2022,
Porównanie metod do określania różnicowej obfitości mykobiomu w ekologicznej uprawie truskawki,
VI Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy różnych środowisk” Puławy, 23 – 24 czerwca 2022 r.,
str. 111
-
2022,
Analiza sieci powiązań bakterii w zdrowych i chorych próbkach ekologicznej truskawki,
XXIX Ogólnopolski Zjazd Polskiego Towarzystwa Mikrobiologów, Warszawa, 15-17.09.2022,
str. 59
-
2022,
Soil microbiome and mycobiome as an important driver of plant health and soil quality,
22nd World Congress of Soil Science "Soil Science crossing boundaries, changing society"; Glasgow, Scotland, 31.07-05.08.2022,
P-666
-
2021,
LAMP – efficient detection of Phytophthora spp. found in organic strawberry plantations,
20th International Workshop for Young Scientists „BioPhys Spring 2021”; Lublin, 18.05.2021,
str. 63
-
2021,
“Shining a LAMP” (Loop-Mediated Isothermal Amplification) on the Molecular Detection of Phytopathogens Phytophthora spp. and Phytophthora cactorum in Strawberry Fields,
Pathogens,
10, 1453, str. 1-15; DOI: 10.3390/pathogens10111453
-
2021,
Sekwencjonowanie nowej generacji w badaniach mikrobiomu próbek gleby i roślin,
IV. Konferencja Doktorantów „Cztery Żywioły - współczesne problemy w naukach o życiu”, 14.12.2022 r., Lublin, Polska,,
str. 18
-
2021,
Różnice w składzie mykobiomu ekologicznych upraw truskawek odmian Honeoye i Aprica,
V Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne pt. „Metagenomy różnych środowisk”, Warszawa, 17-18.06.2021 r.,
str. 53
-
2021,
Aprica strawberry cultivation on four types of soil. Does it impact the mycobiome composition?,
13th International Conference on Agrophysics: Agriculture in changing climate 15-16 November 2021, Lublin, Poland,
str. 181
-
2021,
Czy skład mykobiomu próbek roślin i gleby z plantacji truskawek jest identyczny dla odmian Honeoye, Aprica i Dipred?,
54. Konferencja Mikrobiologiczna „MIKROORGANIZMY RÓŻNYCH ŚRODOWISK”, 20-21 września 2021 r., Lublin,
str. 97
-
2021,
Structural and functional analysis of fungal communities occurring in organic strawberry plantations,
Ogólnopolska Konferencja Mykologiczna dla Studentów i Doktorantów MycoRise Up! Młodzi w mykologii, II Edycja, 23-25. 04.2021 r.,
str. 76-77
-
2021,
Analiza strukturalna i funkcjonalna zbiorowisk grzybów występujących na ekologicznych plantacjach truskawek,
Ogólnopolska konferencja mykologiczna dla studentów i doktorantów "MycoRise Up! Młodzi w mykologii", 23-25.04.2021 ,
str. 76
-
2020,
Triplex Real-Time PCR Approach for the Detection of Crucial Fungal Berry Pathogens—Botrytis spp., Colletotrichum spp. and Verticillium spp.,
International Journal of Molecular Sciences,
21(22), 8469; DOI: 10.3390/ijms21228469
-
2020,
Detection of crucial fungal pathogens of soft fruits in environmental samples derived from organic strawberry plantations,
19th International Workshop for Young Scientists BioPhys Spring 2020, May 19-21, 2020, Prague, Czech Republic,
str. 21
-
2020,
Detekcja roślinnych patogenów grzybowych w środowiskowych próbkach truskawek w zależności od warunków pogodowych i w trakcie przechowywania,
Konferencja Naukowa On-line "Bioróżnorodność środowiska glebowego – wskaźniki oceny", Puławy, 5.11.2020 r.,
str. 52
-
2020,
Interakcje mykobiomu gleby i roślin w ekologicznej uprawie truskawek,
III Konferencja Doktorantów "Cztery Żywioły - współczesne problemy w naukach o życiu", Warszawa, 18.12.2020,
str. 18
-
2019,
Alternative Molecular-Based Diagnostic Methods of Plant Pathogenic Fungi Affecting Berry Crops—A Review,
Molecules,
24(7), 1200, str. 1-25, DOI: 10.3390/molecules24071200
-
2019,
Fungal pathogens in ecological strawberry fields,
18th International Workshop for Young Scientists, BioPhys Spring 2019, May 22-24.05.2019 Gödöllő, Hungary,
str. 26
-
2019,
Isolation of microbial dna from soil – metagenomic approach,
18th International Workshop for Young Scientists, BioPhys Spring 2019, May 22-24.05.2019 Gödöllő, Hungary,
str.31
-
2019,
Porównanie wybranych metod izolacji DNA z gleby w badaniach metataksonomicznych,
IV Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy Różnych Środowisk” Lublin, 27–28.06 2019 r.,
str. 99
-
2019,
Zagrożenie fitopatogenami w ekologicznej uprawie owoców,
II Konferencja Doktorantów "Cztery Żywioły - Współczesne Problemy w Naukach o Życiu", Lublin 24.10.2019 r.,
str. 15
-
2019,
Detekcja i identyfikacja patogenów grzybowych występujących w ekologicznej uprawie truskawek,
Ochrona bioróżnorodności gleby warunkiem zdrowia obecnych i przyszłych pokoleń, Skierniewice, 16.10.2019 r.,
str. 14
-
2019,
Multiplex qPCR method for detection of Verticillium sp. and Phytophthora sp.,,
XVIIII Congress of European Mycologists, 16-21.09.2019 r, Warsaw-Białowieża,,
str. 95
-
2019,
Izolacja DNA z Verticillium sp. i Phytophthora sp.,
53 Ogólnopolska Konferencja Mikrobiologiczna "Mikroorganizmy w zrównoważonym rolnictwie, ochronie środowiska i procesach biotechnologicznych", 8-11.11.2019, Poznań,
str.74