Panek Jacek

Panek Jacek

Print Friendly, PDF & Email
dr Panek Jacek
Nr pokoju: 107a
E-mail: j.panek@ipan.lublin.pl
Nr telefonu: (81) 744 50 61 w. 207

Zakład i laboratorium

Zakład: Zakład Badań Systemu Gleba-Roślina

Publikacje pracownika

  1. 2022, Changes of pectin structure and microbial community composition in strawberry fruit (Fragaria × ananassa Duch.) during cold storage, Food Chemistry, DOI: 10.1016/j.foodchem.2022.132151
  2. 2022, CHANGES IN THE MICROBIOME OF RASPBERRIES AS A RESULT OF THE BENEFICIAL BACTERIA APPLICATION, 21th International Workshop for Young Scientists „BioPhys Spring 2022”; 30-31.05.2022, str. 89-90
  3. 2022, METATAXONOMY IN ORGANIC STRAWBERRY CULTIVATION – WHAT’S THE BIG DEAL?, 21th International Workshop for Young Scientists „BioPhys Spring 2022”; 30-31.05.2022, str. 97-98
  4. 2022, Pozbiorcze zmiany struktury pektyn i zbiorowisk mikroorganizmów w owocach truskawki (Fragaria x ananassa Duch.) uprawianej w systemach produkcji ekologicznej i konwencjonalnej, VII Sympozjum Inżynierii Żywności; Warszawa, 29-30.06.2022, str. 19
  5. 2022, Strategie poprawy efektywności wykorzystania zasobów glebowych poprzez interakcje między roślinami a mikrobiomami – odrębne grupy mikrobiomu odmian ziemniaka i ich troficzne gildie grzybowe, Ogólnopolska Konferencja Naukowa z okazji 10-lecia Polskiego Towarzystwa Mykologicznego; 24-28.09.2022 , str. 66
  6. 2022, W jaki sposób strategie naturalizacji oparte o izolaty Trichoderma spp. wpływają na mykobiom malin porażonych fitopatogenami grzybowymi? Charakterystyka metataksonomiczna, Ogólnopolska Konferencja Naukowa z okazji 10-lecia Polskiego Towarzystwa Mykologicznego; 24-28.09.2022, str. 100
  7. 2022, Czy grzyby tworzą dobre sieci? Sieci grzybowych powiązań w mykobiomie zdrowych i porażonych plantacji truskawki, Ogólnopolska Konferencja Naukowa z okazji 10-lecia Polskiego Towarzystwa Mykologicznego; 24-28.09.2022, str. 111
  8. 2022, Correlations between fungal trophic modes in healthy and unhealthy strawberry samples, MycoRise Up! Youth in Mycology; Warszawa 27-29.05.2022 , str. 21
  9. 2022, Obfitość grzybów fitopatogenicznych oraz pozostałych gildii w glebie, ryzosferze, korzeniach i liściach ekologicznej truskawki, Konferencja Polskiego Towarzystwa Fitopatologicznego „Nowoczesne spojrzenie na fitopatologię”, Poznań, 7-8 Września 2022 r., str. 43
  10. 2022, Metody izolacji fitopatogenów występujących w ekologicznej uprawie truskawki, Konferencja Polskiego Towarzystwa Fitopatologicznego „Nowoczesne spojrzenie na fitopatologię”, Poznań, 7-8 Września 2022 r., str. 138
  11. 2022, Methods of isolating phytopathogens occurring in ecological strawberry cultivation, Konferencja Polskiego Towarzystwa Fitopatologicznego „Nowoczesne spojrzenie na fitopatologię”, Poznań, 7-8 Września 2022 r., str. 139
  12. 2022, Wpływ inokulum bakterii pożytecznych na zdolności funkcjonalne zbiorowisk mikroorganizmów zasiedlających fylosferę i ryzoferę malin, Konferencja Polskiego Towarzystwa Fitopatologicznego „Nowoczesne spojrzenie na fitopatologię”, Poznań, 7-8 Września 2022 r., str. 186
  13. 2022, The effect of beneficial bacteria inoculum on the functional abilities of microbial communities inhabiting raspberry phyllosphere and rhizosphere, Konferencja Polskiego Towarzystwa Fitopatologicznego „Nowoczesne spojrzenie na fitopatologię”, Poznań, 7-8 Września 2022 r., str.187
  14. 2022, Środowiskowe izolaty grzybów należących do rodzaju Neofabraea, powodujące gorzką zgniliznę jabłek w Polsce, Konferencja Polskiego Towarzystwa Fitopatologicznego „Nowoczesne spojrzenie na fitopatologię”, Poznań, 7-8 Września 2022 r., str. 91
  15. 2022, Wpływ kontaminacji gleby patogenem na skład mykobiomu ryzosfery wybranych odmian ziemniaka, VI Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy różnych środowisk” Puławy, 23 – 24 czerwca 2022 r., str. 100
  16. 2022, Wpływ konsorcjum bakterii Arthrobacter sp., Pseudomonas sp. i Rhodococcus spp. na skład taksonomiczny zbiorowisk grzybów zasiedlających ryzosferę i fylosferę malin w doświadczeniu wazonowym, VI Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy różnych środowisk” Puławy, 23 – 24 czerwca 2022 r., str. 102
  17. 2022, Porównanie metod do określania różnicowej obfitości mykobiomu w ekologicznej uprawie truskawki, VI Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy różnych środowisk” Puławy, 23 – 24 czerwca 2022 r., str. 111
  18. 2022, Diagnostyka molekularna grzybów z rodzaju Pezicula – kluczowych patogenów jabłek, VI Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy różnych środowisk” Puławy, 23 – 24 czerwca 2022 r., str. 113
  19. 2022, Nowe rozwiązania biotechnologiczne w diagnostyce i zwalczaniu PEZICULA spp. patogenów grzybowych jabłek. założenia projektu LIDER APPAT(f)REE, XXIX Ogólnopolski Zjazd Polskiego Towarzystwa Mikrobiologów, Warszawa, 15-17.09.2022, str.57
  20. 2022, Analiza sieci powiązań bakterii w zdrowych i chorych próbkach ekologicznej truskawki, XXIX Ogólnopolski Zjazd Polskiego Towarzystwa Mikrobiologów, Warszawa, 15-17.09.2022, str. 59
  21. 2022, Aktywność dehydrogenaz w glebach spod jabłoni w zależności od sposobu zagospodarowania gruntu, Warsztaty dla młodych badaczy, Lublin, 28-29.11.2022, str. 23
  22. 2022, Soil microbiome and mycobiome as an important driver of plant health and soil quality, 22nd World Congress of Soil Science "Soil Science crossing boundaries, changing society"; Glasgow, Scotland, 31.07-05.08.2022, P-666
  23. 2022, Profil metaboliczny zbiorowisk mikroorganizmów w glebach spod jabłoni w zależności od sposobu zagospodarowania gruntu, V Konferencja Doktorantów CZTERY ŻYWIOŁY - Współczesne Problemy w Naukach o Życiu 14.12.2022, str. 43
  24. 2021, Influence of Long-Term Storage on the Caking Properties Determined in Punch Test and Fungal Contamination of Potato Starch and Wheat Flour, Materials, 14(2), 331; DOI: 10.3390/ma14020331
  25. 2021, Mycobiome Composition and Diversity under the Long-Term Application of Spent Mushroom Substrate and Chicken Manure, Agronomy, 11(3), 410; DOI: 10.3390/agronomy11030410
  26. 2021, Fungal X-Intrinsic Protein Aquaporin from Trichoderma atroviride: Structural and Functional Considerations, Biomolecules, 11(2), 338; DOI: 10.3390/biom11020338
  27. 2021, LAMP – efficient detection of Phytophthora spp. found in organic strawberry plantations, 20th International Workshop for Young Scientists „BioPhys Spring 2021”; Lublin, 18.05.2021, str. 63
  28. 2021, “Shining a LAMP” (Loop-Mediated Isothermal Amplification) on the Molecular Detection of Phytopathogens Phytophthora spp. and Phytophthora cactorum in Strawberry Fields, Pathogens, 10, 1453, str. 1-15; DOI: 10.3390/pathogens10111453
  29. 2021, Sekwencjonowanie nowej generacji w badaniach mikrobiomu próbek gleby i roślin, IV. Konferencja Doktorantów „Cztery Żywioły - współczesne problemy w naukach o życiu”, 14.12.2022 r., Lublin, Polska,, str. 18
  30. 2021, Różnice w składzie mykobiomu ekologicznych upraw truskawek odmian Honeoye i Aprica, V Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne pt. „Metagenomy różnych środowisk”, Warszawa, 17-18.06.2021 r., str. 53
  31. 2021, Skład mykobiomu ryzosfery wybranych odmian ziemniaka, V Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne pt. „Metagenomy różnych środowisk”, Warszawa, 17-18.06.2021 r., str. 57
  32. 2021, Różnorodność metataksonomiczna ryzosfery malin a warunki naturalizacji – doświadczenie wazonowe, V Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne pt. „Metagenomy różnych środowisk”, Warszawa, 17-18.06.2021 r., str. 59
  33. 2021, Dynamic changes in the composition and structure of pectin and its relationship with the storage of strawberry, 13th International Conference on Agrophysics: Agriculture in changing climate 15-16 November 2021, Lublin, Poland, str. 53
  34. 2021, Zeolites Na-X and Na-P1 as materials improving soil sorption capacity relative to zinc and lead ions, 13th International Conference on Agrophysics: Agriculture in changing climate 15-16 November 2021, Lublin, Poland, str. 150
  35. 2021, How drought changes mycobiome composition of selected potato cultivars?, 13th International Conference on Agrophysics: Agriculture in changing climate 15-16 November 2021, Lublin, Poland, str. 163
  36. 2021, Aprica strawberry cultivation on four types of soil. Does it impact the mycobiome composition?, 13th International Conference on Agrophysics: Agriculture in changing climate 15-16 November 2021, Lublin, Poland, str. 181
  37. 2021, The impact of natural soil on the response of potato cultivars to biotic and abiotic stresses, 13th International Conference on Agrophysics: Agriculture in changing climate 15-16 November 2021, Lublin, Poland, str. 196
  38. 2021, Międzynarodowy projekt PATATOMETABIONE – opis wykonywanych prac, Ziemniak Polski ISSN 1425-4263 - Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Radzikowie - Państwowy Instytut Badawczy O w Boninie, str. 3
  39. 2021, Czy skład mykobiomu próbek roślin i gleby z plantacji truskawek jest identyczny dla odmian Honeoye, Aprica i Dipred?, 54. Konferencja Mikrobiologiczna „MIKROORGANIZMY RÓŻNYCH ŚRODOWISK”, 20-21 września 2021 r., Lublin, str. 97
  40. 2021, Wpływ suszy na zmiany mykobiomu ryzosfery wybranych odmian ziemniaka, 54. Konferencja Mikrobiologiczna „MIKROORGANIZMY RÓŻNYCH ŚRODOWISK”, 20-21 września 2021 r., Lublin, str. 110
  41. 2021, Zmiany mikrobioty glebowej w wyniku naturalizacji ryzosfery malin bakteriami wyizolowanymi z roślin dzikorosnących, 54. Konferencja Mikrobiologiczna „MIKROORGANIZMY RÓŻNYCH ŚRODOWISK”, 20-21 września 2021 r., Lublin, str. 114
  42. 2021, Structural and functional analysis of fungal communities occurring in organic strawberry plantations, Ogólnopolska Konferencja Mykologiczna dla Studentów i Doktorantów MycoRise Up! Młodzi w mykologii, II Edycja, 23-25. 04.2021 r., str. 76-77
  43. 2021, Analiza strukturalna i funkcjonalna zbiorowisk grzybów występujących na ekologicznych plantacjach truskawek, Ogólnopolska konferencja mykologiczna dla studentów i doktorantów "MycoRise Up! Młodzi w mykologii", 23-25.04.2021 , str. 76
  44. 2020, Influence of storage under unfavourable conditions on the caking properties and fungal contamination of potato starch and wheat flour, International Agrophysics, 34(2): 203-211; DOI: 10.31545/intagr/118413
  45. 2020, Wpływ uprawy bezorkowej na metanotrofię gleby, XII Interdyscyplinarna Konferencja Naukowa TYGIEL 2020 "Interdyscyplinarność kluczem do rozwoju"; Lublin, 21-22.03.2020 r., str. 231-232
  46. 2020, Triplex Real-Time PCR Approach for the Detection of Crucial Fungal Berry Pathogens—Botrytis spp., Colletotrichum spp. and Verticillium spp., International Journal of Molecular Sciences, 21(22), 8469; DOI: 10.3390/ijms21228469
  47. 2020, Detection of crucial fungal pathogens of soft fruits in environmental samples derived from organic strawberry plantations, 19th International Workshop for Young Scientists BioPhys Spring 2020, May 19-21, 2020, Prague, Czech Republic, str. 21
  48. 2020, Detekcja roślinnych patogenów grzybowych w środowiskowych próbkach truskawek w zależności od warunków pogodowych i w trakcie przechowywania, Konferencja Naukowa On-line "Bioróżnorodność środowiska glebowego – wskaźniki oceny", Puławy, 5.11.2020 r., str. 52
  49. 2020, Bioróżnorodność mikrobiomu ryzosfery ziemniaka, Konferencja Naukowa On-line "Bioróżnorodność środowiska glebowego – wskaźniki oceny", Puławy, 5.11.2020 r., str. 58
  50. 2020, Interakcje mykobiomu gleby i roślin w ekologicznej uprawie truskawek, III Konferencja Doktorantów "Cztery Żywioły - współczesne problemy w naukach o życiu", Warszawa, 18.12.2020, str. 18
  51. 2019, Alternative Molecular-Based Diagnostic Methods of Plant Pathogenic Fungi Affecting Berry Crops—A Review, Molecules, 24(7), 1200, str. 1-25, DOI: 10.3390/molecules24071200
  52. 2019, Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) approach for detection of heat-resistant Talaromyces flavus species, Scientific Reports, 5846, DOI: 10.1038/s41598-019-42275-x
  53. 2019, Fungal pathogens in ecological strawberry fields, 18th International Workshop for Young Scientists, BioPhys Spring 2019, May 22-24.05.2019 Gödöllő, Hungary, str. 26
  54. 2019, Isolation of microbial dna from soil – metagenomic approach, 18th International Workshop for Young Scientists, BioPhys Spring 2019, May 22-24.05.2019 Gödöllő, Hungary, str.31
  55. 2019, Porównanie wybranych metod izolacji DNA z gleby w badaniach metataksonomicznych, IV Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy Różnych Środowisk” Lublin, 27–28.06 2019 r., str. 99
  56. 2019, Effect of different organic waste on cellulose-degrading enzymes secreted by Petriella setifera in the presence of cellobiose and glucose, Cellulose, str. 1-18, DOI: 10.1007/s10570-019-02633-4(0123456789().,-volV() 0123458697().,-volV)
  57. 2019, Detekcja i identyfikacja patogenów grzybowych występujących w ekologicznej uprawie truskawek, Ochrona bioróżnorodności gleby warunkiem zdrowia obecnych i przyszłych pokoleń, Skierniewice, 16.10.2019 r., str. 14
  58. 2019, Multiplex qPCR method for detection of Verticillium sp. and Phytophthora sp.,, XVIIII Congress of European Mycologists, 16-21.09.2019 r, Warsaw-Białowieża,, str. 95
  59. 2019, Izolacja DNA z Verticillium sp. i Phytophthora sp., 53 Ogólnopolska Konferencja Mikrobiologiczna "Mikroorganizmy w zrównoważonym rolnictwie, ochronie środowiska i procesach biotechnologicznych", 8-11.11.2019, Poznań, str.74
  60. 2018, Development of a qPCR assay for the detection of heat-resistant Talaromyces flavus, International Journal of Food Microbiology, DOI: 10.1016/j.ijfoodmicro.2018.02.010
  61. 2018, Metabolic and Genetic Properties of Petriella setifera Precultured on Waste, Frontiers in Microbiology, DOI: 10.3389/fmicb.2018.00115
  62. 2018, Intraspecific functional and genetic diversity of Petriella setifera, PeerJ, 6:e4420; DOI 10.7717/peerj.4420
  63. 2018, Intraspecific Metabolic and Genetic Diversity of Heat-Resistant Fungi Talaromyces Flavus, 17th International Workshop for Young Scientists „BioPhys Spring 2018”, Nitra, Slovakia 15-18.05.2018 r., str. 55
  64. 2018, Petriella setifera – Intraspecific functional and genetic diversity, 12th International Conference on Agrophysics: Soil, Plant & Climate, Lublin 17-19.09.2018 r., str. 33
  65. 2018, Assessment of the fungal communities of soil amended with spent mushroom substrate and chicken manure using comparative molecular approaches, 12th International Conference on Agrophysics: Soil, Plant & Climate, Lublin 17-19.09.2018 r., str. 82
  66. 2018, Cellulolytic enzymes of Petriella setifera, 12th International Conference on Agrophysics: Soil, Plant & Climate, Lublin 17-19.09.2018 r., str. 115
  67. 2018, Analiza metagenomiczna biogazu produkowanego z kiszonki kukurydzianej i wywaru zbożowego, III Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy różnych środowisk”, 28-29.06.2018 r., str. 76
  68. 2018, Spiralna reakcja polimerazy (psr) w detekcji Talaromyces flavus, Ogólnopolska Konferencja Mikrobiologiczna "Mikrobiologia środowiska szansą dla biotechnologii i zrównoważonego rozwoju", Katowice, 12-15.06.2018 r., str. 70
  69. 2018, Nowe rozwiązania biotechnologiczne w diagnostyce, zwalczaniu i monitoringu kluczowych patogenów grzybowych w ekologicznej uprawie owoców miękkich, Konferencja Naukowa "Bioróżnorodność funkcjonalna gleb Polski", Puławy, 18-19.10.2018 r. ,
  70. 2018, Patogeny grzybowe w ekologicznej uprawie truskawek., Konferencja Naukowa "Bioróżnorodność funkcjonalna gleb Polski", Puławy, 18-19.10.2018 r.,
  71. 2017, Aktywność enzymów zaangażowanych w szlaki degradacji celulozy oraz stopień jej wykorzystania przez grzyby Petriella setifera, II Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy różnych środowisk”, Lublin, 29-30.06.2017, str. 83-84
  72. 2017, Różnorodność kataboliczna i genetyczna izolatów Petriella setifera hodowanych na odpadach organicznych, II Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy różnych środowisk”, Lublin, 29-30.06.2017, str. 117
  73. 2017, Analiza metagenomiczna odpadów jabłkowych z uprawy ekologicznej, II Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy różnych środowisk”, Lublin, 29-30.06.2017, str. 119
  74. 2017, Direct loop-mediated isothermal amplification (directlamp) for detection of talaromyces flavus, 16th International Workshop for Young Scientists „BioPhys Spring 2017”, Lublin, Poland, 1-3.06.2017, str. 67-68
  75. 2017, Expression of cellulase genes in petriella setifera strains, XXIV Lubelskie Warsztaty Biofizyczne, Kazimierz Dolny nad Wisłą 03-04.07.2017, str. 8
  76. 2017, Wrażliwość niektórych grzybów na biopreparaty, Jagodnik. Wszystko o uprawie roślin jagodowych, 4(34): 12-15
  77. 2017, Oczyszczanie produktu reakcji sekwencjonowania DNA z wykorzystaniem kulek paramagnetycznych, X Sympozjum Doktorantów "Współczesne Problemy w Naukach o Życiu", Lublin, 26.10.2017, str. 20
  78. 2017, Grzyby termooporne Talaromyces flavus w przetwórstwie żywności – nowatorskie metody detekcji, III Kuźnia Młodych Talentów, Jabłonna 27-30.09.2017, str. 42
  79. 2017, Różnorodność funkcjonalna grzybów w odpadach jabłkowych z wykorzystaniem płytek Biolog FF, 51. Ogólnopolska Konferencja Mikrobiologiczna, Toruń 5-8.09.2017, str. 52
  80. 2017, Fungal community composition and functional diversity in apple fruit waste, 23rd International Symposium on Environmental Biogeochemistry, Palm Cove, Australia 24-29.09.2017, str. 59
  81. 2016, Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) for detection of Talaromyces flavus, Book of abstracts. 15th International Workshop for Young Scientists, BioPhys Spring 2016, May 5-6, 2016, Prague, Czech Republic, 42-43
  82. 2016, Porównanie wrażliwości chemicznej dwóch szczepów grzybów termoopornych z gatunku Neosartorya Fischeri., 63-65
  83. 2016, Comparison of Chemical Sensitivity of Fresh and Long-Stored Heat Resistant Neosartorya fischeri Environmental Isolates Using BIOLOG Phenotype MicroArray System, PLoS One, 11(1): e0147605
  84. 2015, Porównanie wybranych metod izolacji DNA grzybów termoopornych z gatunku Talaromyces flavus., 2015, poz. 49, 55-55
  85. 2015, Wpływ dodatku betainy na czułość detekcji Talaromyces flavus techniką real-time PCR., 2015, 25-25
  86. 2015, Wstępne badania dotyczące detekcji grzybów termoopornych z wykorzystaniem łańcuchowej reakcji polimerazy (PCR) / Preliminary study on detection of heat – resistant fungi using polymerase chain reaction (PCR)., 2015, j.pol. 110-110-j.ang. 309-309
  87. 2015, Talaromyces flavus – charakterystyka i znaczenie., Badania i Rozwój Młodych Naukowców w Polsce. Nauki Przyrodnicze Tom I: Część II Poznań 2015, Tom I, Część II: 118-124
  88. 2015, Ocena jakości mikrobiologicznej gleby i truskawek z plantacji przemysłowych., Badania i Rozwój Młodych Naukowców w Polsce. Nauki Przyrodnicze Tom I: Część II Poznań 2015, Tom I, Część II: 111-117
  89. 2015, Characterization of Metabolic Profile of Talaromyces Flavus With BIOLOG FF Microplates., 2015, 106-106
  90. 2015, Real-time PCR for detection of Talaromyces flavus., 2015, 22-22
  91. 2015, Evaluation and optimization of DNA extraction procedures for Talaromyces flavus., 2015, 46-47
  92. 2014, Application of PCR method for detection of heat-resistant fungi belong to the Talaromyces flavus species., 2014, 92-93
  93. 2014, Porównanie efektywności wybranych metod izolacji DNA grzybów fitopatogenicznych z rodzaju Fusarium, 2014, 34-34
  94. 2014, Global carbon utilization profiles of two heat-resistant strains of Neosartorya fischeri using phenotype microarray (PM plates), 2014, 18-19
  95. 2013, Occurrence of heat-resistant fungi in agricultural soils under strawberries cultivation, 2013, 105-105
  96. , Aktywność celulolityczna grzybów Petriella setifera., 51. Ogólnopolska Konferencja Mikrobiologiczna, Toruń 5-8.09.2017, str. 34
X