Panek Jacek

Panek Jacek

Print Friendly, PDF & Email
MSc Eng Panek Jacek
Room: 107a
E-mail: j.panek@ipan.lublin.pl
Phone: (81) 744 50 61 w. 177

Department and laboratory

Department: Department of Soil and Plant System

Publications

  1. 2022, Changes of pectin structure and microbial community composition in strawberry fruit (Fragaria × ananassa Duch.) during cold storage, Food Chemistry, DOI: 10.1016/j.foodchem.2022.132151
  2. 2022, CHANGES IN THE MICROBIOME OF RASPBERRIES AS A RESULT OF THE BENEFICIAL BACTERIA APPLICATION, 21th International Workshop for Young Scientists „BioPhys Spring 2022”; 30-31.05.2022, str. 89-90
  3. 2022, METATAXONOMY IN ORGANIC STRAWBERRY CULTIVATION – WHAT’S THE BIG DEAL?, 21th International Workshop for Young Scientists „BioPhys Spring 2022”; 30-31.05.2022, str. 97-98
  4. 2021, Influence of Long-Term Storage on the Caking Properties Determined in Punch Test and Fungal Contamination of Potato Starch and Wheat Flour, Materials, 14(2), 331; DOI: 10.3390/ma14020331
  5. 2021, Mycobiome Composition and Diversity under the Long-Term Application of Spent Mushroom Substrate and Chicken Manure, Agronomy, 11(3), 410; DOI: 10.3390/agronomy11030410
  6. 2021, Fungal X-Intrinsic Protein Aquaporin from Trichoderma atroviride: Structural and Functional Considerations, Biomolecules, 11(2), 338; DOI: 10.3390/biom11020338
  7. 2021, LAMP – efficient detection of Phytophthora spp. found in organic strawberry plantations, 20th International Workshop for Young Scientists „BioPhys Spring 2021”; Lublin, 18.05.2021, str. 63
  8. 2021, “Shining a LAMP” (Loop-Mediated Isothermal Amplification) on the Molecular Detection of Phytopathogens Phytophthora spp. and Phytophthora cactorum in Strawberry Fields, Pathogens, 10, 1453, str. 1-15; DOI: 10.3390/pathogens10111453
  9. 2021, Sekwencjonowanie nowej generacji w badaniach mikrobiomu próbek gleby i roślin, IV. Konferencja Doktorantów „Cztery Żywioły - współczesne problemy w naukach o życiu”, 14.12.2022 r., Lublin, Polska,, str. 18
  10. 2021, Różnice w składzie mykobiomu ekologicznych upraw truskawek odmian Honeoye i Aprica, V Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne pt. „Metagenomy różnych środowisk”, Warszawa, 17-18.06.2021 r., str. 53
  11. 2021, Skład mykobiomu ryzosfery wybranych odmian ziemniaka, V Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne pt. „Metagenomy różnych środowisk”, Warszawa, 17-18.06.2021 r., str. 57
  12. 2021, Różnorodność metataksonomiczna ryzosfery malin a warunki naturalizacji – doświadczenie wazonowe, V Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne pt. „Metagenomy różnych środowisk”, Warszawa, 17-18.06.2021 r., str. 59
  13. 2021, Dynamic changes in the composition and structure of pectin and its relationship with the storage of strawberry, 13th International Conference on Agrophysics: Agriculture in changing climate 15-16 November 2021, Lublin, Poland, str. 53
  14. 2021, Zeolites Na-X and Na-P1 as materials improving soil sorption capacity relative to zinc and lead ions, 13th International Conference on Agrophysics: Agriculture in changing climate 15-16 November 2021, Lublin, Poland, str. 150
  15. 2021, How drought changes mycobiome composition of selected potato cultivars?, 13th International Conference on Agrophysics: Agriculture in changing climate 15-16 November 2021, Lublin, Poland, str. 163
  16. 2021, Aprica strawberry cultivation on four types of soil. Does it impact the mycobiome composition?, 13th International Conference on Agrophysics: Agriculture in changing climate 15-16 November 2021, Lublin, Poland, str. 181
  17. 2021, The impact of natural soil on the response of potato cultivars to biotic and abiotic stresses, 13th International Conference on Agrophysics: Agriculture in changing climate 15-16 November 2021, Lublin, Poland, str. 196
  18. 2021, Międzynarodowy projekt PATATOMETABIONE – opis wykonywanych prac, Ziemniak Polski ISSN 1425-4263 - Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Radzikowie - Państwowy Instytut Badawczy O w Boninie, str. 3
  19. 2021, Czy skład mykobiomu próbek roślin i gleby z plantacji truskawek jest identyczny dla odmian Honeoye, Aprica i Dipred?, 54. Konferencja Mikrobiologiczna „MIKROORGANIZMY RÓŻNYCH ŚRODOWISK”, 20-21 września 2021 r., Lublin, str. 97
  20. 2021, Wpływ suszy na zmiany mykobiomu ryzosfery wybranych odmian ziemniaka, 54. Konferencja Mikrobiologiczna „MIKROORGANIZMY RÓŻNYCH ŚRODOWISK”, 20-21 września 2021 r., Lublin, str. 110
  21. 2021, Zmiany mikrobioty glebowej w wyniku naturalizacji ryzosfery malin bakteriami wyizolowanymi z roślin dzikorosnących, 54. Konferencja Mikrobiologiczna „MIKROORGANIZMY RÓŻNYCH ŚRODOWISK”, 20-21 września 2021 r., Lublin, str. 114
  22. 2021, Structural and functional analysis of fungal communities occurring in organic strawberry plantations, Ogólnopolska Konferencja Mykologiczna dla Studentów i Doktorantów MycoRise Up! Młodzi w mykologii, II Edycja, 23-25. 04.2021 r., str. 76-77
  23. 2021, Analiza strukturalna i funkcjonalna zbiorowisk grzybów występujących na ekologicznych plantacjach truskawek, Ogólnopolska konferencja mykologiczna dla studentów i doktorantów "MycoRise Up! Młodzi w mykologii", 23-25.04.2021 , str. 76
  24. 2020, Influence of storage under unfavourable conditions on the caking properties and fungal contamination of potato starch and wheat flour, International Agrophysics, 34(2): 203-211; DOI: 10.31545/intagr/118413
  25. 2020, Wpływ uprawy bezorkowej na metanotrofię gleby, XII Interdyscyplinarna Konferencja Naukowa TYGIEL 2020 "Interdyscyplinarność kluczem do rozwoju"; Lublin, 21-22.03.2020 r., str. 231-232
  26. 2020, Triplex Real-Time PCR Approach for the Detection of Crucial Fungal Berry Pathogens—Botrytis spp., Colletotrichum spp. and Verticillium spp., International Journal of Molecular Sciences, 21(22), 8469; DOI: 10.3390/ijms21228469
  27. 2020, Detection of crucial fungal pathogens of soft fruits in environmental samples derived from organic strawberry plantations, 19th International Workshop for Young Scientists BioPhys Spring 2020, May 19-21, 2020, Prague, Czech Republic, str. 21
  28. 2020, Detekcja roślinnych patogenów grzybowych w środowiskowych próbkach truskawek w zależności od warunków pogodowych i w trakcie przechowywania, Konferencja Naukowa On-line "Bioróżnorodność środowiska glebowego – wskaźniki oceny", Puławy, 5.11.2020 r., str. 52
  29. 2020, Bioróżnorodność mikrobiomu ryzosfery ziemniaka, Konferencja Naukowa On-line "Bioróżnorodność środowiska glebowego – wskaźniki oceny", Puławy, 5.11.2020 r., str. 58
  30. 2020, Interakcje mykobiomu gleby i roślin w ekologicznej uprawie truskawek, III Konferencja Doktorantów "Cztery Żywioły - współczesne problemy w naukach o życiu", Warszawa, 18.12.2020, str. 18
  31. 2019, Alternative Molecular-Based Diagnostic Methods of Plant Pathogenic Fungi Affecting Berry Crops—A Review, Molecules, 24(7), 1200, str. 1-25, DOI: 10.3390/molecules24071200
  32. 2019, Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) approach for detection of heat-resistant Talaromyces flavus species, Scientific Reports, 5846, DOI: 10.1038/s41598-019-42275-x
  33. 2019, Fungal pathogens in ecological strawberry fields, 18th International Workshop for Young Scientists, BioPhys Spring 2019, May 22-24.05.2019 Gödöllő, Hungary, str. 26
  34. 2019, Isolation of microbial dna from soil – metagenomic approach, 18th International Workshop for Young Scientists, BioPhys Spring 2019, May 22-24.05.2019 Gödöllő, Hungary, str.31
  35. 2019, Porównanie wybranych metod izolacji DNA z gleby w badaniach metataksonomicznych, IV Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy Różnych Środowisk” Lublin, 27–28.06 2019 r., str. 99
  36. 2019, Effect of different organic waste on cellulose-degrading enzymes secreted by Petriella setifera in the presence of cellobiose and glucose, Cellulose, str. 1-18, DOI: 10.1007/s10570-019-02633-4(0123456789().,-volV() 0123458697().,-volV)
  37. 2019, Detekcja i identyfikacja patogenów grzybowych występujących w ekologicznej uprawie truskawek, Ochrona bioróżnorodności gleby warunkiem zdrowia obecnych i przyszłych pokoleń, Skierniewice, 16.10.2019 r., str. 14
  38. 2019, Multiplex qPCR method for detection of Verticillium sp. and Phytophthora sp.,, XVIIII Congress of European Mycologists, 16-21.09.2019 r, Warsaw-Białowieża,, str. 95
  39. 2019, Izolacja DNA z Verticillium sp. i Phytophthora sp., 53 Ogólnopolska Konferencja Mikrobiologiczna "Mikroorganizmy w zrównoważonym rolnictwie, ochronie środowiska i procesach biotechnologicznych", 8-11.11.2019, Poznań, str.74
  40. 2018, Development of a qPCR assay for the detection of heat-resistant Talaromyces flavus, International Journal of Food Microbiology, DOI: 10.1016/j.ijfoodmicro.2018.02.010
  41. 2018, Metabolic and Genetic Properties of Petriella setifera Precultured on Waste, Frontiers in Microbiology, DOI: 10.3389/fmicb.2018.00115
  42. 2018, Intraspecific functional and genetic diversity of Petriella setifera, PeerJ, 6:e4420; DOI 10.7717/peerj.4420
  43. 2018, Intraspecific Metabolic and Genetic Diversity of Heat-Resistant Fungi Talaromyces Flavus, 17th International Workshop for Young Scientists „BioPhys Spring 2018”, Nitra, Slovakia 15-18.05.2018 r., str. 55
  44. 2018, Petriella setifera – Intraspecific functional and genetic diversity, 12th International Conference on Agrophysics: Soil, Plant & Climate, Lublin 17-19.09.2018 r., str. 33
  45. 2018, Assessment of the fungal communities of soil amended with spent mushroom substrate and chicken manure using comparative molecular approaches, 12th International Conference on Agrophysics: Soil, Plant & Climate, Lublin 17-19.09.2018 r., str. 82
  46. 2018, Cellulolytic enzymes of Petriella setifera, 12th International Conference on Agrophysics: Soil, Plant & Climate, Lublin 17-19.09.2018 r., str. 115
  47. 2018, Analiza metagenomiczna biogazu produkowanego z kiszonki kukurydzianej i wywaru zbożowego, III Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy różnych środowisk”, 28-29.06.2018 r., str. 76
  48. 2018, Spiralna reakcja polimerazy (psr) w detekcji Talaromyces flavus, Ogólnopolska Konferencja Mikrobiologiczna "Mikrobiologia środowiska szansą dla biotechnologii i zrównoważonego rozwoju", Katowice, 12-15.06.2018 r., str. 70
  49. 2018, Nowe rozwiązania biotechnologiczne w diagnostyce, zwalczaniu i monitoringu kluczowych patogenów grzybowych w ekologicznej uprawie owoców miękkich, Konferencja Naukowa "Bioróżnorodność funkcjonalna gleb Polski", Puławy, 18-19.10.2018 r. ,
  50. 2018, Patogeny grzybowe w ekologicznej uprawie truskawek., Konferencja Naukowa "Bioróżnorodność funkcjonalna gleb Polski", Puławy, 18-19.10.2018 r.,
  51. 2017, Aktywność enzymów zaangażowanych w szlaki degradacji celulozy oraz stopień jej wykorzystania przez grzyby Petriella setifera, II Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy różnych środowisk”, Lublin, 29-30.06.2017, str. 83-84
  52. 2017, Różnorodność kataboliczna i genetyczna izolatów Petriella setifera hodowanych na odpadach organicznych, II Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy różnych środowisk”, Lublin, 29-30.06.2017, str. 117
  53. 2017, Analiza metagenomiczna odpadów jabłkowych z uprawy ekologicznej, II Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy różnych środowisk”, Lublin, 29-30.06.2017, str. 119
  54. 2017, Direct loop-mediated isothermal amplification (directlamp) for detection of talaromyces flavus, 16th International Workshop for Young Scientists „BioPhys Spring 2017”, Lublin, Poland, 1-3.06.2017, str. 67-68
  55. 2017, Expression of cellulase genes in petriella setifera strains, XXIV Lubelskie Warsztaty Biofizyczne, Kazimierz Dolny nad Wisłą 03-04.07.2017, str. 8
  56. 2017, Wrażliwość niektórych grzybów na biopreparaty, Jagodnik. Wszystko o uprawie roślin jagodowych, 4(34): 12-15
  57. 2017, Oczyszczanie produktu reakcji sekwencjonowania DNA z wykorzystaniem kulek paramagnetycznych, X Sympozjum Doktorantów "Współczesne Problemy w Naukach o Życiu", Lublin, 26.10.2017, str. 20
  58. 2017, Grzyby termooporne Talaromyces flavus w przetwórstwie żywności – nowatorskie metody detekcji, III Kuźnia Młodych Talentów, Jabłonna 27-30.09.2017, str. 42
  59. 2017, Różnorodność funkcjonalna grzybów w odpadach jabłkowych z wykorzystaniem płytek Biolog FF, 51. Ogólnopolska Konferencja Mikrobiologiczna, Toruń 5-8.09.2017, str. 52
  60. 2017, Fungal community composition and functional diversity in apple fruit waste, 23rd International Symposium on Environmental Biogeochemistry, Palm Cove, Australia 24-29.09.2017, str. 59
  61. 2016, Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) for detection of Talaromyces flavus, Book of abstracts. 15th International Workshop for Young Scientists, BioPhys Spring 2016, May 5-6, 2016, Prague, Czech Republic, 42-43
  62. 2016, Porównanie wrażliwości chemicznej dwóch szczepów grzybów termoopornych z gatunku Neosartorya Fischeri., 63-65
  63. 2016, Comparison of Chemical Sensitivity of Fresh and Long-Stored Heat Resistant Neosartorya fischeri Environmental Isolates Using BIOLOG Phenotype MicroArray System, PLoS One, 11(1): e0147605
  64. 2015, Porównanie wybranych metod izolacji DNA grzybów termoopornych z gatunku Talaromyces flavus., 2015, poz. 49, 55-55
  65. 2015, Wpływ dodatku betainy na czułość detekcji Talaromyces flavus techniką real-time PCR., 2015, 25-25
  66. 2015, Wstępne badania dotyczące detekcji grzybów termoopornych z wykorzystaniem łańcuchowej reakcji polimerazy (PCR) / Preliminary study on detection of heat – resistant fungi using polymerase chain reaction (PCR)., 2015, j.pol. 110-110-j.ang. 309-309
  67. 2015, Talaromyces flavus – charakterystyka i znaczenie., Badania i Rozwój Młodych Naukowców w Polsce. Nauki Przyrodnicze Tom I: Część II Poznań 2015, Tom I, Część II: 118-124
  68. 2015, Ocena jakości mikrobiologicznej gleby i truskawek z plantacji przemysłowych., Badania i Rozwój Młodych Naukowców w Polsce. Nauki Przyrodnicze Tom I: Część II Poznań 2015, Tom I, Część II: 111-117
  69. 2015, Characterization of Metabolic Profile of Talaromyces Flavus With BIOLOG FF Microplates., 2015, 106-106
  70. 2015, Real-time PCR for detection of Talaromyces flavus., 2015, 22-22
  71. 2015, Evaluation and optimization of DNA extraction procedures for Talaromyces flavus., 2015, 46-47
  72. 2014, Application of PCR method for detection of heat-resistant fungi belong to the Talaromyces flavus species., 2014, 92-93
  73. 2014, Porównanie efektywności wybranych metod izolacji DNA grzybów fitopatogenicznych z rodzaju Fusarium, 2014, 34-34
  74. 2014, Global carbon utilization profiles of two heat-resistant strains of Neosartorya fischeri using phenotype microarray (PM plates), 2014, 18-19
  75. 2013, Occurrence of heat-resistant fungi in agricultural soils under strawberries cultivation, 2013, 105-105
  76. , Aktywność celulolityczna grzybów Petriella setifera., 51. Ogólnopolska Konferencja Mikrobiologiczna, Toruń 5-8.09.2017, str. 34
X