Siczek Anna

Siczek Anna

Print Friendly, PDF & Email
PhD Siczek Anna
Room: 111
E-mail: a.siczek@ipan.lublin.pl
Phone: (81) 744 50 61 w. 154

Department and laboratory

Department: Department of Soil and Plant System

Interest

Research interests:

  • Soil properties and symbiotic nitrogen fixation
  • The effects of soil compaction on plant growth

Other information

Education (dates, degrees, universities):

  • 2003    MSc  in Biotechnology
    Faculty of Biology and Earth Sciences, Marie Curie-Sklodowska University in Lublin, Poland
    MSc thesis “Identification of pssL gen of Rhizobium leguminosarum bv. trifolli TA1 and elaboration of PssL protein topological model”
  • 2009    PhD in Agricultural Sciences (Agronomy-Agrophysics)
    Institute of Agrophysics PAS, Lublin, Poland
    Dissertation “The effect of soil compaction and mulching on soybean root system and shoots growth”

Scholarships and fellowships:

  • Polish Agrophysical Society

Publications

  1. 2019, Initial growth and root surface properties of dicotyledonous plants in structurally intact field soil and compacted headland soil, Soil & Tillage Research, 195, str. 1-10, DOI: 10.1016/j.still.2019.104387
  2. 2019, Effect of different organic waste on cellulose-degrading enzymes secreted by Petriella setifera in the presence of cellobiose and glucose, Cellulose, str. 1-18, DOI: 10.1007/s10570-019-02633-4(0123456789().,-volV() 0123458697().,-volV)
  3. 2018, Nowe rozwiązania biotechnologiczne w diagnostyce, zwalczaniu i monitoringu kluczowych patogenów grzybowych w ekologicznej uprawie owoców miękkich, Konferencja Naukowa "Bioróżnorodność funkcjonalna gleb Polski", Puławy, 18-19.10.2018 r. ,
  4. 2018, Zróżnicowanie populacji grzybów w ryzosferze bobiku i pszenicy, Konferencja Naukowa "Bioróżnorodność funkcjonalna gleb Polski", Puławy, 18-19.10.2018 r., str. 87
  5. 2018, Changes in genetic diversity of soil microorganisms after pentachlorophenol contamination, 12th International Conference on Agrophysics: Soil, Plant & Climate, Lublin 17-19.09.2018 r., str. 121
  6. 2018, Plant specific effects on soil activity andmicrobial structure, 12th International Conference on Agrophysics: Soil, Plant & Climate, Lublin 17-19.09.2018 r., str. 120
  7. 2018, Cellulolytic enzymes of Petriella setifera, 12th International Conference on Agrophysics: Soil, Plant & Climate, Lublin 17-19.09.2018 r., str. 115
  8. 2018, Petriella setifera – Intraspecific functional and genetic diversity, 12th International Conference on Agrophysics: Soil, Plant & Climate, Lublin 17-19.09.2018 r., str. 33
  9. 2018, Effects of soil deformation on clay dispersion in loess soil, Soil & Tillage Research, 184: 203-206
  10. 2018, Impact of Apple Pomace Additives to Soil on Growth of Broad Bean, 17th International Workshop for Young Scientists „BioPhys Spring 2018”, Nitra, Slovakia 15-18.05.2018 r., str. 25
  11. 2018, Zmiany mikrobiomu bakteryjnego w ryzosferze bobiku pod wpływem pentachlorofenolu, III Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy różnych środowisk”, 28-29.06.2018 r., str 123
  12. 2018, Soil microbial activity of faba bean (Vicia faba L.) and wheat (Triticum aestivum L.) rhizosphere during growing season, Applied Soil Ecology, DOI: 10.1016/j.apsoil.2018.05.012
  13. 2018, Intraspecific functional and genetic diversity of Petriella setifera, PeerJ, 6:e4420; DOI 10.7717/peerj.4420
  14. 2018, Metabolic and Genetic Properties of Petriella setifera Precultured on Waste, Frontiers in Microbiology, DOI: 10.3389/fmicb.2018.00115
  15. 2017, Charakterystyka biopreparatu metaferm i ocena wpływu jego stosowania na produkcję biogazu, I Ogólnopolska Konferencja Naukowa „Biotechnologia - Energia Jutra”, Lublin 19-20.10.2017, str. 73
  16. 2017, Fungal community composition and functional diversity in apple fruit waste, 23rd International Symposium on Environmental Biogeochemistry, Palm Cove, Australia 24-29.09.2017, str. 59
  17. , Aktywność celulolityczna grzybów Petriella setifera., 51. Ogólnopolska Konferencja Mikrobiologiczna, Toruń 5-8.09.2017, str. 34
  18. 2017, Pentachlorophenol-induced changes in soil activity, 23rd International Symposium on Environmental Biogeochemistry, Palm Cove, Australia 24-29.09.2017, str. 55-56
  19. 2017, Plant-specific effects of faba bean and wheat on soil enzymes activities and functional diversity, 23rd International Symposium on Environmental Biogeochemistry, Palm Cove, Australia 24-29.09.2017, str. 54
  20. 2018, Soil compaction-induced changes of physicochemical properties of cereal roots, Soil & Tillage Research, 175: 226-233
  21. 2017, Efficient Cellulases Production by Trichoderma atroviride G79/11 in Submerged Culture Based on Soy Flour-Cellulose-Lactose, Bioresources, 12(4): 8468-8489
  22. 2017, Expression of cellulase genes in petriella setifera strains, XXIV Lubelskie Warsztaty Biofizyczne, Kazimierz Dolny nad Wisłą 03-04.07.2017, str. 8
  23. 2017, Characterization and Influence of a Multi-enzymatic Biopreparation for Biogas Yield Enhancement, BioResources, 12(3): 6187-6206
  24. 2017, Benefits of flavonoids and straw mulch application on soil microbial activity in pea rhizosphere, International Journal of Environmental Science and Technology, pp. 1–10
  25. 2017, Zróżnicowanie genetyczne rizobiów zasiedlających brodawki bobiku-wpływ czynników Nod, II Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy różnych środowisk”, Lublin, 29-30.06.2017, str. 131
  26. 2017, Różnorodność kataboliczna i genetyczna izolatów Petriella setifera hodowanych na odpadach organicznych, II Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy różnych środowisk”, Lublin, 29-30.06.2017, str. 117
  27. 2017, Aktywność enzymów zaangażowanych w szlaki degradacji celulozy oraz stopień jej wykorzystania przez grzyby Petriella setifera, II Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy różnych środowisk”, Lublin, 29-30.06.2017, str. 83-84
  28. 2016, Effect of sand grain shape on root and shoot growth of wheat seedlings, Geoderma, 265: 1-5
  29. 2016, Wpływ szczepionki bakteryjnej na aktywność mikrobiologiczną gleby, Warsztaty naukowe pt. „Mikroorganizmy symbiotyczne w nauce i praktyce”, Puławy, 19.02.2016 r., 138-139
  30. 2016, Rate of leaching of organic and inorganic compounds in tilled and orchard soils, Bioactive Compounds in Agricultural Soils, 131-148
  31. 2016, Impact of Faba Bean-Seed Rhizobial Inoculation on Microbial Activity in the Rhizosphere Soil during Growing Season, International Journal of Molecular Sciences, 17(5): 784
  32. 2015, The response of rhizosphere microbial properties to flavonoids and NOD factors., Acta Agriculturae Scandinavica Section B-Soil and Plant Science, 65(2): 125-131
  33. 2015, Spatial distribution of soil physical properties as related with soil deformation and mulching,, 2015
  34. 2015, Effects of soil deformation and surface mulching on soil physical properties and soybean response related to weather conditions., Soil & Tillage Research, 153: 175-184
  35. 2014, Wykorzystanie źródeł węgla przez szczep Trichoderma wyizolowany z osadu ścieków mleczarskich., 2014, 53-56
  36. 2014, Ocena zróżnicowania genetycznego bakterii w masie fermentacyjnej bioodpadów na podstawie genu 16S rDNA metodą elektroforezy w gradiencie czynnika denaturującego., 2014, 89-89
  37. 2014, Leaching kinetics of atrazine and inorganic chemicals in tilled and orchard soils., International Agrophysics, 2014, 28(2): 231-237
  38. 2014, Symbiotic Activity of Pea (Pisum sativum) after Application of Nod Factors under Field Conditions., International Journal of Molecular Sciences, 2014, 157344-7351
  39. 2013, The characterization of nitrifying bacteria community in soil rhizosphere after mineral and organic (dairy sewage sludge) fertilization, 2013, 110-110
  40. 2013, Nod Factors (Lipo-Chitooligosaccharides) effects on symbiotic nitrogen fixation and microbial properties in pea rhizosphere, 2013, 111-111
  41. 2013, Pea growth and symbiotic activity response to Nod factors (lipo- chitooligosaccharides) and soil compaction, Applied Soil Ecology, 2013, 72181-186
  42. 2013, Metabolic diversity and characterization of selected cellulolytic fungi isolated from organic waste, 2013
  43. 2013, Genetic and biochemical identification of microorganisms isolated from agricultural and food wastes for methane fermentation process, 2013
  44. 2013, Flawonoidy oraz czynniki Nod (lipochito-oligosacharydy) modyfikują aktywność mikroorganizmów ryzosfery grochu., 47 Ogólnopolska Konferencja Naukowa „Mikroorganizmy-roślina-środowisko w warunkach zmieniającego się klimatu”, 12-15.05.2013, Puławy-Lublin , str. 234-234
  45. 2013, Badania skriningowe, z wykorzystaniem systemu Biolog FF-plates, w zakresie uzdolnień katabolicznych grzybów wyizolowanych z kiszonek., 2013, 201-201
  46. 2013, Identyfikacja molekularna bakterii wyodrębnionych z wybranych odpadów organicznych oraz ocena ich aktywności celulolitycznej., 2013, 108-108
  47. 2012, Mycological characterization of dairy sewage sludge and its influence on soil microbial activity, Annual Report Polish Academy of Sciences, 2012, 37-40
  48. 2012, Wpływ ściółkowania oraz molekularnych sygnałów symbiozy na wzrost grochu, V Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Agrofizycznego pt: ”Agrofizyka dla produkcji rolniczej i przemysłu spożywczego”, 19-21.09.2012, Puławy, str. 77-78
  49. 2012, Effects of soil compaction on root elongation and anatomy of different cereal plant species., Soil & Tillage Research, 2012, 12174-81
  50. 2012, Soil microbial activity as influenced by compaction and straw mulching., International Agrophysics, 2012, 2665-69
  51. 2012, Methane fermentation process for utilization of organic waste: biogas-profitability study for chosen substrates, 2012
  52. 2012, Isolation, identification and screening of cellulolytic microorganisms from soil and organic waste, 2012, 2145-2145
  53. 2012, Biochemical potential and molecular identification of microorganisms isolated from soil and different organic wastes, 2012, 2131-2131
  54. 2012, Dynamika zmian aktywności proteolitycznej i celulolitycznej szczepów Aspergillus sp. na podłożu zawierającym produkty odpadowe przemysłu spożywczego, 2012, 55-55
  55. 2012, Aktywność i różnorodność metaboliczna mikroorganizmów w wybranych warstwach gleby nawożonej osadem z oczyszczalni ścieków mleczarskich, 2012, 52-53
  56. 2012, Charakterystyka mikrobiologiczna wybranych odpadów organicznych, ze szczególnym uwzględnieniem bakterii i grzybów celulolitycznych, 2012, 50-51
  57. 2011, Soil microbial properties in response to compaction and straw mulching, International Conference Agrophysics for Quality of Life, 31.05-3.06.2011, Lublin, str. 100-101
  58. 2011, Effects of land use on leaching of nitrate-N, ammonium-N and phosphate in relation to stained surface area, International Agrophysics, 2011, 25(2): 149-154
  59. 2011, Soybean nodulation and nitrogen fixation in response to soil compaction and surface straw mulching, Soil & Tillage Research, 2011, 114(1): 50-56
  60. 2010, Plonowanie soi i wiązanie azotu w aspektach zróżnicowanej gęstości gleby i ściółkowania, 2010, 32-33
  61. 2010, Symbiotic activity of soybean as influenced by soil compaction and mulching, 2010, 468-471
  62. 2009, Influence of orchard and tillage management practices on soil leaching of atrazine, potassium, magnesium, manganese, iron, ammonium, nitrates and phosphates., 2009
  63. 2009, Soybean nodulation and symbiotic nitrogen fixation in response to soil compaction and mulching., 2009
  64. 2009, The effect of mulching and soil compaction on fungi composition and microbial communities in the rhizosphere of soybean., 2009
  65. 2009, Impact of orchard and tillage management practices on soil leaching of atrazine, potassium, magnesium, manganese, iron, ammonium, nitrates and phosphates., 2009
  66. 2009, Wpływ ściółkowania i zagęszczenia na aktywność enzymatyczną gleby pod soją., 2009
  67. 2009, Wpływ zagęszczenia gleby i ściółkowania na wybrane właściwości fizyczne gleby oraz wzrost i plonowanie soi., III Sprawozdawcza Sesja Naukowa, Jakość Środowiska, Surowców i Żywności, Lublin, 30-31.03.2009 r. ,
  68. 2009, Ocena aktywności enzymatycznej w ryzosferze soi pod wpływem ściółkowania i zagęszczenia gleby., 2009
  69. 2009, Brodawkowanie i wiązanie azotu przez soję w zależności od stanu zagęszczenia gleby i ściółkowania., 2009
  70. 2009, Woda w glebie – pomiary naziemne i satelitarne w misji ESA SMOS., 2009
  71. 2008, Zmienność przestrzenna wilgotności w różnych stanach zagęszczenia gleby., 2008
  72. 2008, Wilgotność gleby w skali pola i gminy dla potrzeb walidacji obserwacji satelitarnych w misji ESA SAMOS., 2008
  73. 2008, Mulching and soil compaction effects on soybean yield and nodulation., 2008
  74. 2008, Leaching of potassium, magnesium, manganese and iron in relation to porosity of tilled and orchard loamy soil., Acta Agriculturae Scandinavica Section B-Soil and Plant Science, 58: 60-65
  75. 2008, Macro-porosity and leaching of atrazine in tilled and orchard loamy soils., Chemosphere, 2008, 70 , 1973-1978
  76. 2008, Plonowanie soi w zależności od zagęszczenia gleby i ściółkowania, 2008
  77. 2008, Wpływ zagęszczenia gleby i ściółkowania na wybrane właściwości fizyczne gleby oraz wzrost soi i wiązanie azotu., II Sympozjum Naukowe "Jakość Środowiska Surowców i Żywności", Poznań, 01-03.04.2008 r.,
  78. 2008, Effects of soil texture and wetness on thermal conductivity., 2008
  79. 2007, Leaching of some agricultural chemicals In relation to pore structure and preferential flow., 2007
  80. 2007, Spatial variability of moisture and temperature In relation to soil compaction and mulching., 2007
  81. 2007, Vertical distribution of soybean roots in relation to soil compaction and mulching., 2007
  82. 2007, Wpływ zmienności przestrzennej zagęszczenia gleby na rozmieszczenie i funkcjonowanie systemu korzeniowego pszenicy., Sympozjum Naukowe "Jakość Środowiska, Surowców i Żywności", Lublin, 30.03.2007 r.
  83. 2007, Rozwój roślin w zależności od stanu fizycznego gleby-wybrane metody badań., Instytut Agrofizyki PAN, 2007, Prace doktorantów w ramach projektu nr Z/2.06/II/2.6/01/05 "Stypendia dla młodych naukowców szansą agrorozwoju Lubelszczyzny", Instytut Agrofizyki im. B. Dobrzańskiego PAN , Lublin, 2007, 39-45
  84. 2006, Effect of soil management on leaching of some agricultural chemicals, Sixth International Scientific Conference Influence of anthropogenic activities on water regime of lowland territory and 16. Slovak-Czech-Polish Scientific Seminar Physics of soil water. Vinianske jazero Lake, Hotel Jazero, Slovak Republic,, 6-8.06.2006 (ISBN 80-89139-09-4)
  85. 2006, Effect of land management on leaching of some agricultural chemicals., International Scientific Student's Conference, Nitra, Slovak Republic, 25-26.04.2006, str. 248-249 (ISBN 80-8069-690-X)
  86. 2006, Wymywanie herbicydów i składników pokarmowych w zależności od sposobu użytkowania gleby., Katolicki Uniwersytet Lubelski Jana Pawła II, Kuratorium Oświaty w Lublinie, 2006, ("Człowiek a środowisko", część III): 131-134
  87. 2006, Wpływ zagęszczenia gleby i mulczowaniana brodawkowanie, wzrost i plonowanie soi w warunkach klimatycznych Lubelszczyzny., Instytut Agrofizyki PAN, 2006, Transfer wiedzy do praktyki rolniczej. Prace doktorantów w ramach projektu "Stypendia dla młodych doktorantów szansą agrorozwoju Lubelszczyzny", 61-64
  88. 2005, Effect of land use on leaching of atrazine, 2005
  89. 2005, Leaching of atrazine in tilled and orchard silty loam soil, Institute of Agrophyscis PAS, Lublin, "Review of Current Problems in Agrophysics", Chapter 5, Physics and Physical Chemistry in Environmental Processes: 459-460
X