• angielski
  • polski
Szukaj
Dokładne dopasowanie
Szukaj w tytułach
Szukaj w treści
Search in comments
Search in excerpt
Filtruj wg rodzaju treści
Aktualności
Publikacje
Pracownicy
Instytut Agrofizyki im. Bohdana Dobrzańskiego Polskiej Akademii Nauk
 

Aparatura

> Zakłady > Zakład Badań Systemu Gleba-Roślina > Laboratorium Mikrobiologii Molekularnej i Środowiskowej > Aparatura

Zakład Badań Systemu Gleba-Roślina

Aparatura

Sekwenator nowej generacji (MiSeq System illumina)

Podstawowe parametry:

  • Wysokoprzepustowy sekwenator DNA do masowego równoległego sekwencjonowania DNA w konfiguracji umożliwiającej:
    • analizę bibliotek poprzez masowe równoległe sekwencjonowanie bez stosowania emulsyjnego PCR w trybie pojedynczego odczytu oraz sparowanych końców
    • analizę gotowych i zaprojektowanych paneli genowych z możliwością wykorzystania co najmniej 10 Gb (10 miliardów par zasad) przepustowości
    • sekwencjonowanie de novo w trybie sparowanych końców
    • sekwencjonowanie de novo i resekwencjonowanie bibliotek DNA przygotowanych bez stosowania mechanicznej fragmentacji DNA
    • identyfikację bakterii i grzybów na podstawie sekwencji rybosomalnego DNA, składające sekwencje DNA z kilku amplikonów
  • Metoda sekwencjonowania: sekwencjonowanie poprzez syntezę

Sekwenator MinION (Oxford Nanopore Technologies)

Podstawowe parametry:

  • Przenośny sekwenator nanoporowy umożliwiający sekwencjonowanie DNA/RNA w czasie rzeczywistym (technologia nanoporowa)
  • Długie odczyty (do kilku Mb), idealne do:
    • asemblacji genomów de novo
    • identyfikacji wariantów strukturalnych
    • analizy genomowej bez amplifikacji
    • analizy modyfikacji epigenetycznych DNA
  • Dokładność odczytu: ~95–99%
  • Przepustowość: do 50 Gb danych na pojedynczy przebieg

Holotomograf NANOLIVE

Podstawowe parametry:

  • Tomograficzny mikroskop holograficzny 3D pozwalający na mapowanie trójwymiarowego rozkładu współczynnika załamania światła w materiale biologicznym:
    • kamera z czujnikiem typu CMOS o rozdzielczości co najmniej 1024×1024 pikseli, umożliwiająca rejestrację obrazu z szybkością co najmniej 160 fps
    • laser: 520 nm
    • maksymalna moc na próbce: 25mW/cm2
    • obiektyw o powiększeniu co najmniej 60x oraz NA co najmniej 0.8 umieszczony pod próbką
    • pole pomiarowe: minimum 80×80 µm
    • mikroskop wyposażony w układ tomografii optycznej bazujący na obrotowym lustrze umieszczonym ponad próbką
  • Inkubator montowany magnetycznie na stoliku mikroskopu, wyposażony w moduł kontroli wilgotności, miksera gazów i sterowanie temperaturą w zakresie 25°C do 50°C, z dokładnością 0,3°C

Aparat do automatycznej elektroforezy żelowej DNA i RNA (TapeStation 4150)

Podstawowe parametry:

  • Automatyczne określenie wielkości, ilości i jakości materiału
  • Automatyczne pobieranie próbek przy pomocy jednorazowych końcówek
  • Analiza elektroforetyczna materiału poprzez pomiar fluorescencji wzbudzonej LED
  • Analiza materiału na jednorazowych taśmach z oddzielonymi od siebie mikrokanałami (możliwa analiza od 1 do 16 próbek)
  • Zużycie próbki: 2 µl
  • Minimalna czułość pomiaru:
    • RNA: od 150 pg/µl
    • DNA: od 15 pg/µl
    • genomowe DNA: od 1,5 ng/µl

Automatyczny system do izolacji kwasów nukleinowych i białek (QIAcube)

Podstawowe parametry:

  • robot wykorzystujący standardowe, kolumienkowe zestawy do izolacji kwasów nukleinowych
    • DNA genomowe
    • DNA plazmidowe
    • DNA cleanup
    • RNA
  • robot wykorzystujący standardowe, kolumienkowe zestawy do izolacji białek
  • robot wyposażony w system pipetowania, wirówkę i wytrząsarkę

Analizator genetyczny 3130

Podstawowe parametry:

  • Aparat 4 kapilarowy do rozdziału elektroforetycznego fragmentów DNA metodą kapilarną umożliwiający sekwencjonowanie i analizę długości fragmentów DNA
  • Dokładność odczytu przy sekwencjonowaniu 98,5%
  • Dokładność odczytu przy analizie fragmentów 99,99%
  • Oprogramowanie umożliwiające:
    • zbieranie i przechowywanie danych
    • identyfikację bakterii i grzybów na podstawie sekwencji rybosomalnego DNA, składające sekwencje DNA z kilku amplikonów,
  • Zintegrowane biblioteki sekwencji rybosomalnych bakterii i grzybów, umożliwiające identyfikację badanych mikroorganizmów

Termocykler do Real-Time PCR z komputerem i oprogramowaniem 7500 Fast

 

Podstawowe parametry:

  • Termocykler na elementach Peltiera 96 dołkowy do pracy z płytkami lub probówkami w paskach o objętości 0,1 ml
  • Urządzenie wyposażone w kamerę do rejestracji obrazu fluorescencyjnego
  • Możliwość detekcji w minimum 5 kanałach: -FAM/SYBR Green I, -VIC/JOE, – NED/TAMRA/Cy3, – ROX/Texas Red, – Cy5
  • Możliwość zastosowania barwnika ROX oraz innych barwników jako pasywną kontrolę fluorescencji

Termocykler gradientowy 9901 Veriti 96

 

Podstawowe parametry:

  • Urządzenie wyposażone jest w 96-dołkowy blok (format 96 x 0,1 ml) wykonany z 6 odrębnych stref na bloku sterowanym przy użyciu efektu Peltiera.
  • Jednorodność temperatury próbek w całym bloku +/-0,5°C
  • Możliwość ustawienia różnicy temperatur między strefami 4°C, jak i ustawienia jednorodnego profilu termicznego na całym bloku
  • Zakres temperatur od 4,0°C do 99,9°C

System umożliwiający analizę DGGE

 

Podstawowe parametry:

  • System umożliwiający analizę mutacji DNA za pomocą techniki DGGE (elektroforezy w gradiencie żelu denaturującego)
  • System składa się z modułu termostatującego oraz dwóch komór elektroforetycznych, w tym jednej z rdzeniami ceramicznymi oraz rdzenia przytrzymującego żele podczas elektroforezy
  • Umożliwia przeprowadzenie elektroforezy dwóch żeli jednocześnie
  • Urządzenie zapewnia mieszanie buforu do elektroforezy oraz podgrzewanie i utrzymanie stałej temperatury w zakresie 45-70°C
  • Zasilacz z programowalnym napięciem, natężeniem i mocą prądu

Aparat do elektroforezy agarozowej

 

Podstawowe parametry:

  • Aparaty do elektroforezy kwasów nukleinowych w żelu agarozowym
  • Aparaty do rozdziału fragmentów restrykcyjnych DNA oraz fragmentów DNA po amplifikacji metodą PCR
  • Aparaty posiadają w zestawie urządzenia do wylewania żeli poza komorą elektroforetyczną
  • Zasilacz do elektroforezy z programowalnym napięciem i natężeniem

Aparat do ekstrakcji DNA FastPrep®-24

 

Podstawowe parametry:

  • Czas pracy w zakresie od 1 do 60 sekund z przyrostem co 1 s
  • Prędkość w zakresie 4,0–6,5 m/s, z przyrostem co 0,5 m/s
  • Zainstalowany adapter posiada 24 pozycje na 2 ml probówki
  • Adapter na probówki z blokiem chłodzącym posiada 24 pozycje na 2 ml probówki

 

 

Spektrofotometr do pomiaru stężenia DNA NanoDrop2000

 

Podstawowe parametry:

  • Spektrofotometr UV/VIS do pomiaru próbek z mikroobjętości
  • Objętość mierzonej próbki 0,5 μl (niezależnie od stężenia próbki)
  • Zakres długości fali 190-840 nm
  • Pomiar odbywa się bez użycia kuwet, mikrokuwet i tipsów
  • Zakres pomiaru stężenia DNA: 2-15 000 ng/μl bez potrzeby powtarzania pomiaru próbki o nieznanym stężeniu, bez konieczności zagęszczania lub rozcieńczania
  • Czas całego cyklu pomiarowego ≤ 5 sek

Cyfrowy system do dokumentacji żeli z komputerową stacją roboczą i oprogramowaniem GelDocXR+ Imaging System

 

Podstawowe parametry:

  • Aparat umożliwia wizualizację, zapis i analizę próbek znakowanych fluorescencyjnie i kolorymetrycznie
  • Posiada zintegrowaną mini-ciemnię optyczną z wbudowanym transiluminatorem UV i oświetleniem światłem białym
  • Transiluminator wyposażony jest w lampy UV o długości 302 nm UV-B
  • Urządzenie wyposażone jest w filtry dla barwników, takich jak: bromek etydyny, Sybr Green
  • Oprogramowanie umożliwia obróbkę obrazu, pozwala na automatyczne rozpoznawanie ścieżek i prążków, umożliwia rysowanie dendrogramów

Automatyczny system do szybkiej identyfikacji mikroorganizmów: Turbidymetr, Mikrostacja, OmniLog, Mikroskop, Anoxomat, AeroSpray

 

Podstawowe parametry:

  • Kompletny system do automatycznej identyfikacji bakterii: gram (-), gram (+), gatunku Bacillus, bakterii beztlenowych, drożdży i grzybów strzępkowych
  • System do identyfikacji drobnoustrojów na mikropłytkach 96 -dołkowych wyposażony jest w bazę danych zawierającą 2000 gatunków bakterii, drożdży i grzybów
  • System zapewnia określenie podobieństwa, odległości i prawdopodobieństwo bakterii w bazie danych
  • System umożliwia zapisywanie w bazie danych badanych mikroorganizmów i wyświetlanie ich w postaci dendrogramów
  • System wyposażony jest w stację czytania mikropłytek 96 dołkowych do identyfikacji i charakteryzacji mikroorganizmów (drożdży, beztlenowców i grzybów)
  • System wyposażony jest w automatyczną stację identyfikacji mikroorganizmów (bakterii gram (+), gram (-) ), umożliwiającą inkubację, odczyt i interpretację wyników do 50 mikropłytek 96 dołkowych (zakres temperatury inkubacji 22-45⁰C)
  • System wyposażony w turbidymetr, aparat do automatycznego barwienia metodą Grama, aparat do wytwarzania atmosfery beztlenowej lub niskotlenowej oraz mikroskop optyczny

Czytnik mikropłytek z komputerową stacją roboczą i oprogramowaniem INFINITE M200PRO

 

Podstawowe parametry:

  • Urządzenie mające możliwość łączenia funkcji fluorymetru, systemu fotometrycznego i luminomentru
  • Metody detekcji: absorbancja ze źródłem światła – ksenonowa lampa UV, fluorescencja z góry
  • Zakres długości fali absorbacnji: od 230 nm do 1000 nm
  • Możliwość współpracy z różnymi formatami płytek: od 6 do 384-dołkowych
  • Czas odczytu płytki 96 dołkowej – 20 sekund
  • Urządzenie wyposażone w płytkę kwarcową do wielorazowego użytku do 16 jednoczesnych pomiarów ilościowych i jakościowych stężenia DNA, RNA i białek z objętości 2 ml
  • Wbudowana wytrząsarka do płytek z możliwością wyboru szybkości i kierunku wytrząsania

Automatyczne urządzenie do przyrządzania i sterylizowania podłoży mikrobiologicznych Masterclave 09

 

Podstawowe parametry:

  • Komora umożliwiająca jednorazowe przygotowanie od 1 do 9 litrów podłoża lub rozcieńczalnika
  • Urządzenie wyposażone w mieszadło magnetyczne o pracy ciągłej 40 rpm
  • Temperatura sterylizacji w zakresie 95-125⁰C
  • Czas sterylizacji w zakresie 1-180 minut
  • Temperatura rozlewu w zakresie 25-80⁰C
  • Aparat umożliwia utrzymywanie stałej temperatury podczas dodawania suplementu

Urządzenie do automatycznego przygotowywania rozcieńczeń Dilumat S

 

Podstawowe parametry:

  • Szybkość dozowania rozcieńczalnika – do 200 ml/min
  • Automatycznie poruszane ramię (obrotowe)
  • Zakres rozcieńczenia: od 1:2 do 1:99
  • Masa naważki: w zakresie 0 – 2500 g

Urządzenie do rozlewania płytek APS One

 

Podstawowe parametry:

  • Prędkość rozlewu: do 650 płytek w ciągu godziny
  • Wybór objętości podłoża wylanego na płytkę w zakresie od 1 do 30 ml
  • Funkcja manualnego rozlewania w zakresie od 1- do 1000 ml
  • Funkcja ustawiania płytek w stos
  • Aparat wyposażony w system chłodzenia rozlewanego medium
  • Rozlew w sterylnej komorze UV
  • Czas otwarcia płytki podczas rozlewu poniżej 3 sekund
  • Obracanie płytki i mieszanie podłoża na płytce podczas rozlewu, umożliwiające równomierne rozłożenie podłoża na płytce

Licznik kolonii z wyposażeniem Easy Count2 7510/AES

 

Podstawowe parametry:

  • Licznik umożliwia automatyczne zliczanie kolonii z szalek Petriego o średnicy do 90 mm z posiewów powierzchniowych, wgłębnych i spiralnych
  • Możliwość zliczania kolonii z każdego rodzaju agaru
  • Możliwość tworzenia obszarów, na których kolonie mają być zliczane
  • Automatyczne klasyfikowanie kolonii w zależności od barwy
  • Automatyczna separacja kolonii nakładających się
  • Możliwość archiwizowania wyników zliczania oraz dokumentacji obrazów

Stacja robocza do PCR EPMotion 5070

 

Podstawowe parametry:

  • Automatyczna stacja pipetująca, pozwalająca na pracę z wykorzystaniem 4 miejsc, w których mogą znajdować się płytki, probówki w statywach oraz końcówki dla głowic dozujących. Stacja wyposażona jest w dodatkowe miejsce na pojemnik na zużyte końcówki
  • Stacja umożliwia pracę z płytkami 24, 48, 96 i 384 dołkowymi oraz probówkami 0,2; 0,5; 1,5 oraz 2,0 ml

Autoklaw FVG2

 

Podstawowe parametry:

  • Pojemność użytkowa 75 l
  • Zakres temperatur: 105-138oC
  • Komora autoklawu wykonana ze stali kwasoodpornej

 

 

 

Automatyczny przesiewacz AS200 Control

 

Podstawowe parametry:

  • Maksymalne obciążenie – 3 kg
  • Zakres amplitudy od 0,2 do 3,0 mm
  • Przesiewanie na sucho i na mokro

 

 

 

Aparat do pomiaru czystości mikrobiologicznej powietrza Sampl’air

 

Podstawowe parametry:

  • Przepustowość 100 litrów na minutę
  • Przeznaczony dla standardowych płytek Petriego 90 mm
  • Możliwość pracy z opóźnieniem od 00:00 do 00:59
Zakłady
Projekty
X