Zakład i laboratorium
	
			Zakład: Zakład Badań Systemu Gleba-Roślina
	
	
				
	
				
	
				
	
				
	
				
	
				
						
						
						
						Publikacje pracownika
	
	
	
			- 
										
									2025, 
				
											Impact of microbial-based biopreparations on soil quality, plant health, and fruit chemistry in raspberry cultivation, 
									
									Food Chemistry, 
																	462, 140943, DOI: 10.1016/j.foodchem.2024.140943
							
- 
										
																								- 
										Sisodia Priyal, 
									
- 
										Gryta Agata, 
									
- 
										Panek Jacek, 
									
- 
										Siegieda Dominika, 
									
- 
										Mącik Mateusz, 
									
- 
										Pylak Michał, 
									
- 
										Oszust Karolina, 
									
- 
										Pathan Shamina Imran, 
									
- 
										Pietramellara Giacomo, 
									
- 
										Frąc Magdalena, 
									
 2024, 
				
											Shaping the bacterial and fungal microbiome in legume-cereal intercropping, 
									
													23rd International Workshop for Young Scientists „BioPhys Spring 2024”; Lublin, Poland, 23-24 maja 2024 r., 
													str. 131-132
- 
										
									2024, 
				
											Ecological processes of bacterial microbiome assembly in healthy and dysbiotic strawberry farms, 
									
													BMC Plant Biology , 
													24: 692; DOI: 10.1186/s12870-024-05415-8
							
- 
										
									2024, 
				
											Analiza sieci powiązań zbiorowisk bakterii w uprawie współrzędnej pszenicy i koniczyny, 
									
													VIII Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy Różnych Środowisk”, Lublin, 17-18 czerwca 2024 r., 
													str. 61
							
- 
										
									2024, 
				
											Mikrobiom glebowy pod lupą: funkcjonalna analiza zbiorowisk bakterii w uprawach współrzędnych zbóż i roślin bobowatych, 
									
													VIII Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy Różnych Środowisk”, Lublin, 17-18 czerwca 2024 r., 
													str. 100
							
- 
										
									2024, 
				
											Mikrobiom endosymbiotyczny grzybów Serendipita indica, 
									
													VIII Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy Różnych Środowisk”, Lublin, 17-18 czerwca 2024 r., 
													str. 105
							
- 
										
									2024, 
				
											Wpływ uprawy współrzędnej pszenicy wraz z mieszanką trawy i koniczyny na bioróżnorodność zbiorowisk bakterii w podpowierzchniowych warstwach gleby w rolnictwie ekologicznym, 
									
													VIII Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy Różnych Środowisk”, Lublin, 17-18 czerwca 2024 r., 
													str. 111
							
- 
										
									2024, 
				
											Głębokość czy rodzaj uprawy? Co ma większy wpływ na różnorodność mikrobiomów bakteryjnych i grzybowych w glebie?, 
									
													VIII Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy Różnych Środowisk”, Lublin, 17-18 czerwca 2024 r., 
													str. 118
							
- 
										
									2024, 
				
											Pierwsze kroki do opisania niescharakteryzowanego patogena roślin – Pilidium lythri, 
									
													IV Ogólnopolska Konferencja Polskiego Towarzystwa Mykologicznego, Lublin, 20-22 września 2024 r., 
													str. 42
							
- 
										
									2024, 
				
											Mykobiom jako składnik holobiontu roślinnego i mikrobiomu glebowego dla zrównoważonej produkcji i zdrowia agroekosystemów, 
									
													IV Ogólnopolska Konferencja Polskiego Towarzystwa Mykologicznego, Lublin, 20-22 września 2024 r., 
													str. 100
							
- 
										
									2024, 
				
											Mykobiom w służbie zdrowia gleby: jak sposób uprawy kształtuje profil funkcjonalny zbiorowisk grzybów?, 
									
													IV Ogólnopolska Konferencja Polskiego Towarzystwa Mykologicznego, Lublin, 20-22 września 2024 r., 
													str. 115
							
- 
										
									2024, 
				
											Wpływ uprawy współrzędnej pszenicy na skład taksonomiczny oraz wskaźniki bioróżnorodności zbiorowisk grzybów występujących w warstwach podpowierzchniowych gleby w uprawie ekologicznej, 
									
													IV Ogólnopolska Konferencja Polskiego Towarzystwa Mykologicznego, Lublin, 20-22 września 2024 r., 
													str. 121
							
- 
										
									2024, 
				
											Analiza różnorodności genetycznej zbiorowisk mikroorganizmów  w warstwach podpowierzchniowych gleby w różnych systemach uprawy  zbóż i roślin bobowatych, 
									
													56 Ogólnopolska Konferencja Mikrobiologiczna „Mikrolobiczne wyzwania – rozwiązania dla środowiska i zdrowia”, Bydgoszcz, Fojutowo, 11-13 września 2024 r., 
											
- 
										
									2024, 
				
											Analiza funkcjonalna genomu Serendipita indica, 
									
													56 Ogólnopolska Konferencja Mikrobiologiczna „Mikrolobiczne wyzwania – rozwiązania dla środowiska i zdrowia”, Bydgoszcz, Fojutowo, 11-13 września 2024 r., 
											
- 
										
									2024, 
				
											Holobiont roślinny i mikrobiom glebowy szansą dla zrównoważonej produkcji i zdrowia agroekosystemów, 
									
													VI Konferencja Naukowa „Bioróżnorodność środowiska glebowego”, Puławy, 5-6 września 2024 r., 
													31-31
							
- 
										
									2024, 
				
											Analiza rezystomu endofitycznego grzyba Serendipita indica, 
									
													VI Konferencja Naukowa „Bioróżnorodność środowiska glebowego”, Puławy, 5-6 września 2024 r., 
													45-45
							
- 
										
									2024, 
				
											Wpływ ekologicznej uprawy współrzędnej pszenicy na wskaźniki bioróżnorodności zbiorowisk mikroorganizmów glebowych w warstwach podpowierzchniowych gleby, 
									
													VI Konferencja Naukowa „Bioróżnorodność środowiska glebowego”, Puławy, 5-6 września 2024 r., 
													47-47
							
- 
										
									2023, 
				
											Plant and soil health in organic strawberry farms – Greater importance of fungal trophic modes and networks than α-diversity of the mycobiome, 
									
													Applied Soil Ecology, 
													vol. 188, 104925; DOI: 10.1016/j.apsoil.2023.104925
							
- 
										
									2023, 
				
											How to approach biodiversity analysis in metagenomic studies, 
									
													14th International Conference on Agrophysics (ICA 2023); Lublin, Polska, 11-13 września 2023 r., 
													63-63
							
- 
										
									2023, 
				
											An alarming abundance of Pilidium sp., an emerging phytopathogen, in organic strawberry farms in Poland, 
									
													14th International Conference on Agrophysics (ICA 2023); Lublin, Polska, 11-13 września 2023 r., 
													140-140
							
- 
										
																								- 
										Mącik Mateusz, 
									
- 
										Panek Jacek, 
									
- 
										Gryta Agata, 
									
- 
										Oszust Karolina, 
									
- 
										Pertile Giorgia, 
									
- 
										Siegieda Dominika, 
									
- 
										Pylak Michał, 
									
- 
										Pathan Shamina Imran, 
									
- 
										Pietramellara Giacomo, 
									
- 
										Frąc Magdalena, 
									
 2023, 
				
											Legume-cereal intercropping as a tool for improving soil quality and plant health, 
									
													14th International Conference on Agrophysics (ICA 2023); Lublin, Polska, 11-13 września 2023 r., 
													142-142
- 
										
									2023, 
				
											Sztuczna inteligencja w badaniach zdrowotności upraw truskawek, 
									
													VII Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „METAGENOMY RÓŻNYCH ŚRODOWISK” 2023, Lublin, 20-21 czerwca 2023 r., 
													120-120
							
- 
										
									2023, 
				
											Zbiorowiska bakterii zdrowych i zainfekowanych patogenami plantacji truskawek – zróżnicowanie obfitości i bogactwa mikrobioty, 
									
													VII Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „METAGENOMY RÓŻNYCH ŚRODOWISK” 2023, Lublin, 20-21 czerwca 2023 r., 
													158-158
							
- 
										
																								- 
										Frąc Magdalena, 
									
- 
										Panek Jacek, 
									
- 
										Gryta Agata, 
									
- 
										Oszust Karolina, 
									
- 
										Pertile Giorgia, 
									
- 
										Siegieda Dominika, 
									
- 
										Mącik Mateusz, 
									
- 
										Pylak Michał, 
									
- 
										Pathan Shamina Imran, 
									
- 
										Pietramellara Giacomo, 
									
 2023, 
				
											Uprawa współrzędna zbóż i roślin bobowatych dla rozwoju zrównoważonego rolnictwa – bioróżnorodność i aspekt metagenomiczny, 
									
													VII Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „METAGENOMY RÓŻNYCH ŚRODOWISK” 2023, Lublin, 20-21 czerwca 2023 r., 
													162-162
- 
										
																								- 
										Mącik Mateusz, 
									
- 
										Panek Jacek, 
									
- 
										Gryta Agata, 
									
- 
										Oszust Karolina, 
									
- 
										Pertile Giorgia, 
									
- 
										Siegieda Dominika, 
									
- 
										Pylak Michał, 
									
- 
										Pathan Shamina Imran, 
									
- 
										Pietramellara Giacomo, 
									
- 
										Frąc Magdalena, 
									
 2023, 
				
											Zastosowanie strategii uprawy współrzędnej roślin bobowatych i zbóż do optymalizacji bilansu azotu i jakości mikrobiologicznej gleby, 
									
													55 jubileuszowa konferencja mikrobiologiczna „Mikrobiologia w badaniach środowiskowych – rys historyczny i perspektywy na przyszłość”, Puławy, 14-15 września 2023 r., 
													82-82
- 
										
									2023, 
				
											Tracking depletion and enrichment of mycobiomes in healthy and unhealthy strawberry plant and soil niches, 
									
													4th conference „MycoRiseUP! Youth in Mycology”,  Lublin, 20-21 May 2023 r., 
													57-57
							
- 
										
									2023, 
				
											Soil microbiomes biodiversity in agroecosystems, 
									
													3rd Global Soil Biodiversity Conference, Dublin, Ireland, 13-15.03.2023 r. , 
													467-467
							
- 
										
									2022, 
				
											METATAXONOMY IN ORGANIC STRAWBERRY CULTIVATION – WHAT’S THE BIG DEAL?, 
									
													21th International Workshop for Young Scientists „BioPhys Spring 2022”; 30-31.05.2022, 
													str. 97-98
							
- 
										
									2022, 
				
											Strategie poprawy efektywności wykorzystania zasobów glebowych poprzez interakcje  między roślinami a mikrobiomami – odrębne grupy mikrobiomu odmian ziemniaka i ich  troficzne gildie grzybowe, 
									
													Ogólnopolska Konferencja Naukowa z okazji 10-lecia Polskiego Towarzystwa Mykologicznego; 24-28.09.2022 , 
													str. 66
							
- 
										
									2022, 
				
											Czy grzyby tworzą dobre sieci? Sieci grzybowych powiązań w mykobiomie zdrowych i  porażonych plantacji truskawki, 
									
													Ogólnopolska Konferencja Naukowa z okazji 10-lecia Polskiego Towarzystwa Mykologicznego; 24-28.09.2022, 
													str. 111
							
- 
										
									2022, 
				
											Correlations between fungal trophic modes in healthy and unhealthy strawberry samples, 
									
													MycoRise Up! Youth in Mycology; Warszawa 27-29.05.2022 , 
													str. 21
							
- 
										
									2022, 
				
											Obfitość grzybów fitopatogenicznych oraz pozostałych gildii w glebie,  ryzosferze, korzeniach i liściach ekologicznej truskawki, 
									
													Konferencja Polskiego Towarzystwa Fitopatologicznego „Nowoczesne spojrzenie na fitopatologię”, Poznań, 7-8 Września 2022 r., 
													str. 43
							
- 
										
									2022, 
				
											Porównanie metod do określania różnicowej obfitości mykobiomu w ekologicznej uprawie truskawki, 
									
													VI Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy różnych środowisk” Puławy, 23 – 24 czerwca 2022 r., 
													str. 111
							
- 
										
									2022, 
				
											Analiza sieci powiązań bakterii w zdrowych i chorych próbkach ekologicznej truskawki, 
									
													XXIX Ogólnopolski Zjazd Polskiego Towarzystwa Mikrobiologów, Warszawa, 15-17.09.2022, 
													str. 59
							
- 
										
									2022, 
				
											Soil microbiome and mycobiome as an important driver of plant health and soil quality, 
									
													22nd World Congress of Soil Science "Soil Science crossing boundaries, changing society"; Glasgow, Scotland, 31.07-05.08.2022, 
													P-666
							
- 
										
									2021, 
				
											LAMP – efficient detection of Phytophthora spp. found in organic strawberry plantations, 
									
													20th International Workshop for Young Scientists „BioPhys Spring 2021”; Lublin, 18.05.2021, 
													str. 63
							
- 
										
									2021, 
				
											“Shining a LAMP” (Loop-Mediated Isothermal Amplification) on the Molecular Detection of Phytopathogens Phytophthora spp. and Phytophthora cactorum in Strawberry Fields, 
									
													Pathogens, 
													10, 1453, str. 1-15; DOI: 10.3390/pathogens10111453
							
- 
										
									2021, 
				
											Sekwencjonowanie nowej generacji w badaniach mikrobiomu próbek gleby i roślin, 
									
													IV. Konferencja Doktorantów „Cztery Żywioły - współczesne problemy w naukach o życiu”, 14.12.2022 r., Lublin, Polska,, 
													str. 18
							
- 
										
									2021, 
				
											Różnice w składzie mykobiomu ekologicznych upraw truskawek odmian Honeoye i Aprica, 
									
													V Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne pt. „Metagenomy różnych środowisk”, Warszawa, 17-18.06.2021 r., 
													str. 53
							
- 
										
									2021, 
				
											Aprica strawberry cultivation on four types of soil. Does it impact the mycobiome composition?, 
									
													13th International Conference on Agrophysics: Agriculture in changing climate 15-16 November 2021, Lublin, Poland, 
													str. 181
							
- 
										
									2021, 
				
											Czy skład mykobiomu próbek roślin i gleby z plantacji truskawek jest identyczny dla odmian Honeoye, Aprica i Dipred?, 
									
													54. Konferencja Mikrobiologiczna „MIKROORGANIZMY RÓŻNYCH ŚRODOWISK”, 20-21 września 2021 r., Lublin, 
													str. 97
							
- 
										
									2021, 
				
											Structural and functional analysis of fungal communities occurring in organic strawberry plantations, 
									
													Ogólnopolska Konferencja Mykologiczna dla Studentów i Doktorantów MycoRise Up! Młodzi w mykologii, II Edycja, 23-25. 04.2021 r., 
													str. 76-77
							
- 
										
									2021, 
				
											Analiza strukturalna i funkcjonalna zbiorowisk grzybów występujących na ekologicznych plantacjach truskawek, 
									
													Ogólnopolska konferencja mykologiczna dla studentów i doktorantów "MycoRise Up! Młodzi w mykologii", 23-25.04.2021 , 
													str. 76
							
- 
										
									2020, 
				
											Triplex Real-Time PCR Approach for the Detection of Crucial Fungal Berry Pathogens—Botrytis spp., Colletotrichum spp. and Verticillium spp., 
									
													International Journal of Molecular Sciences, 
													21(22), 8469; DOI: 10.3390/ijms21228469
							
- 
										
									2020, 
				
											Detection of crucial fungal pathogens of soft fruits in environmental samples derived from organic strawberry plantations, 
									
													19th International Workshop for Young Scientists BioPhys Spring 2020, May 19-21, 2020, Prague, Czech Republic, 
													str. 21
							
- 
										
									2020, 
				
											Detekcja roślinnych patogenów grzybowych w środowiskowych próbkach truskawek w zależności od warunków pogodowych i w trakcie przechowywania, 
									
													Konferencja Naukowa On-line "Bioróżnorodność środowiska glebowego – wskaźniki oceny", Puławy, 5.11.2020 r., 
													str. 52
							
- 
										
									2020, 
				
											Interakcje mykobiomu gleby i roślin w ekologicznej uprawie truskawek, 
									
													III Konferencja Doktorantów "Cztery Żywioły - współczesne problemy w naukach o życiu", Warszawa, 18.12.2020, 
													str. 18
							
- 
										
									2019, 
				
											Alternative Molecular-Based Diagnostic Methods of Plant Pathogenic Fungi Affecting Berry Crops—A Review, 
									
													Molecules, 
													24(7), 1200, str. 1-25, DOI: 10.3390/molecules24071200
							
- 
										
									2019, 
				
											Fungal pathogens in ecological strawberry fields, 
									
													18th International Workshop for Young Scientists, BioPhys Spring 2019, May 22-24.05.2019 Gödöllő, Hungary, 
													str. 26
							
- 
										
									2019, 
				
											Isolation of microbial dna from soil – metagenomic approach, 
									
													18th International Workshop for Young Scientists, BioPhys Spring 2019, May 22-24.05.2019 Gödöllő, Hungary, 
													str.31
							
- 
										
									2019, 
				
											Porównanie wybranych metod izolacji DNA z gleby w badaniach metataksonomicznych, 
									
													IV Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy Różnych Środowisk” Lublin, 27–28.06 2019 r., 
													str. 99
							
- 
										
									2019, 
				
											Zagrożenie fitopatogenami w ekologicznej uprawie owoców, 
									
													II Konferencja Doktorantów "Cztery Żywioły - Współczesne Problemy w Naukach o Życiu", Lublin 24.10.2019 r., 
													str. 15
							
- 
										
									2019, 
				
											Detekcja i identyfikacja patogenów grzybowych występujących w ekologicznej uprawie truskawek, 
									
													Ochrona bioróżnorodności gleby warunkiem zdrowia obecnych i przyszłych pokoleń, Skierniewice, 16.10.2019 r., 
													str. 14
							
- 
										
									2019, 
				
											Multiplex qPCR method for detection of Verticillium sp. and Phytophthora sp.,, 
									
													XVIIII Congress of European Mycologists, 16-21.09.2019 r, Warsaw-Białowieża,, 
													str. 95
							
- 
										
									2019, 
				
											Izolacja DNA z Verticillium sp. i Phytophthora sp., 
									
													53 Ogólnopolska Konferencja Mikrobiologiczna "Mikroorganizmy w zrównoważonym rolnictwie, ochronie środowiska i procesach biotechnologicznych", 8-11.11.2019, Poznań, 
													str.74